野生桂花的遗传多样性和遗传结构研究.docVIP

园 艺 学 报 2014，41（7）：1427–1435 http: // www. ahs. ac. cn Acta Horticulturae Sinica E-mail: yuanyixuebao@126.com 收稿日期：2014–03–04；修回日期：2014–05–16 基金项目：国家自然科学基金项目31160043）；国家科技支撑计划项目（2012BAC11B02）；江西省教育厅科技计划项目 （GJJ2241） * 通信作者 Author for correspondence（E-mail：dmf.625@163.com） 野生桂花的遗传多样性和遗传结构研究 胡 菀1,2，罗 意2，阳 亿2，张志勇2，范邓妹2,* （1江西农业大学林学院，南昌 330045；2江西农业大学，亚热带生物多样性实验室，南昌 330045） 摘 要：利用细胞核微卫星（nuclear microsatellite，nSSR）标记对中国4个省的7个野生桂花[ Osmanthus fragrans （Thunb.）Lour.]群体139个个体的遗传多样性和遗传结构进行了研究。11个微卫星位点揭示了 野生桂花等位基因多样性（ A ）平均为6.039，有效等位基因数（ N e）平均为3.769，平均预期杂合度（ H e） 为0.673。所有群体均显著偏离哈温平衡，近交系数 F IS介于0.313 ~ 0.580之间。群体间遗传分化系数 F ST = 0.143，AMOVA分析表明群体间遗传分化占总遗传变异的12.69%，群体内的遗传变异为87.31%。Mantel 检验表明野生桂花群体间遗传距离与地理距离不存在相关性（ r =–0.277， P = 0.214）。STRUCTURE聚类 分析显示，所有个体被划分为3个理论群体，庐山群体和浏阳群体中谱系较为单纯，而其他群体则存在 一定程度的遗传混杂。瓶颈效应分析显示，除浏阳群体外所有群体经历了种群衰退。 关键词：野生桂花；微卫星标记；遗传多样性；遗传结构 中图分类号：S 685.13 文献标志码：A 文章编号：0513-353X（2014）07-1427-09 Genetic Diversity and Population Genetic Structure of Wild Sweet Osmanthus Revealed by Microsatellite Markers HU Wan1,2，LUO Yi2，YANG Yi2，ZHANG Zhi-yong2，and FAN Deng-mei2,* （1 College of Forestry ， Jiangxi Agricultural University ， Nanchang 330045， China ；2 Laboratory of Subtropical Biodiversity ， Jiangxi Agricultural University ， Nanchang 330045， China ） Abstract：Genetic diversity and genetic structure of 139 individuals from seven wild populations of Osmanthus fragrans in four provinces of China were studied with nuclear microsatellite（nSSR）markers. A relatively high level of genetic diversity was detected in O . fragrans with 11 polymorphic microsatellite loci. Average Allelic diversity（ A ），effective number of alleles（ N e）and mean expected heterozygosity （ H e）were 6.039，3.769 and 0.673，respectively. All populations deviated from Hardy-Weinberg equilibrium significantly，with inbreeding coefficient（ F IS）rang