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免疫印迹SOP
免疫印迹技术(Immunobloting) SOP
免疫印迹从早期用抗体直接“着染”聚丙烯酰胺凝胶内的蛋白(Burridge 1976;Showe 等1976)发展为现如今使用多样化复制技术的方法。对于仅有50多年历史的分子生物学来说,30岁的免疫印迹,即“Western Blot”可谓“古老”。尽管它存在这样那样的问题,但仍然广泛应用于多种基因功能、转基因检测等实验中。命名为“Western Blot”,与“Northern Blot”一样,完全源于科学家的幽默。在一次鸡尾酒会上,某人(现在已无人考证)开了这样一个玩笑,所有人都笑了,这个命名就这样延续了下来。咱们书归正传,下面让我们来介绍一下本实验室的Western Blot的实验流程、注意事项以及一点点心得体会。
一、样品制备
(一)鱼血清样品制备
1.将冻存后的鱼血清4℃融化。
2.血清10000r/m,5min,离心,取上清和(2×)loading buffer等体积混匀。
3.沸水煮样,3-5min,10000 r/m,5min,离心,取上清上样。
(二)细胞样品制备
1.取细胞3000 r/m,5min,将细胞用PBS洗三遍。
2.将细胞样品和(2×)loading buffer等体积混匀。
3.沸水煮样,3-5min,10000 r/m,5min,离心,取上清上样。
(三)组织样品制备
1.在组织块中加入少量的液氮,快速敲击,将组织研碎,少量液氮,反复几次。
2.边加液氮,边加(2×)loading buffer细胞裂解液,继续研磨,4℃放置一会,待buffer变回液体状,回收。
3.沸水煮样,3-5min,10000 r/m,5min,离心,取上清上样。
(四)注意事项
1.由于日本七鳃鳗血清中含有大量的胶原蛋白,如果不将其去除会对后面的实验以及Co-IP都会产生很大的影响,所以在煮样前先将其10000r/m离心,取上清,去除胶原蛋白。
2.处理细胞时一定要将细胞清洗干净,因为用来培养细胞的培养基或是冻存液中含有非常丰富的BSA(牛血清白蛋白)之类的蛋白质,若直接用这种样品去WB会有非常大的麻烦,尤其当你的蛋白在60-46 kDa之间的时候;用“任何”抗体去检测这一区间的蛋白,会有一片非常强的信号。因为此区间蛋白(主要是BSA)浓度过于富集,会非特异性粘附“任意”抗体,从而最终被识别。
3.样品核酸、蛋白浓度过高时,煮样后会发现tip吸不上来,非常粘、一砣一砣的,很容易堵住tip。这时候常规做法有:①再煮5min。②1ml用注射器反复吹打。③再就是超声破碎,要注意超声破碎的条件,超声时间不易超过5min,停顿时间要长于超声时间,总的超声时间要依据样品量以及样品的粘稠程度而定,若不是很粘稠,1min即可。(从经验看,超声的效果要好于注射器吹打的效果)
二、蛋白电泳
电泳胶的制备、配方、缓冲液配方,请参考分子克隆,这里就不一一赘述。本实验室采用
JM-250型蛋白电泳仪,浓缩胶采用86V,分离胶采用156V。
注意事项:
1. 30%聚丙烯酰胺会降解,要4度避光保存。
2.配胶用玻璃板和边条应及时洗净。玻板未洗净的坏处很多。尽管玻璃看似平滑,但是一些细微的凹陷处会凝结肉眼无法分辨的胶颗粒(摸上去疙疙瘩瘩),其坏处是,在该部位极易导致不均匀的胶块,样品经过该处或电泳散热不好,条带变形。玻板没洗净的另一个坏处是,由中学物理知识可知,玻璃表面越光滑粘附越牢,未洗净的玻板会削弱和胶体间的粘附力,拔梳子或边条时会产生微小的错动,胶体下部出现大量气泡(夹在玻板和胶之间,这个关系不大);严重的错动会使上样时,样品从胶和玻璃之间的间隙漏光,或者甚至胶和玻板分开。
3.上样时,不要把tip深入胶孔过深(或者采用细的尖端拉长的专用上样枪头),可能会错开胶和玻板,样品会泄露。
4.增加上样量不一定会提高荧光信号强度。增加上样量的后果通常只能是让你的内参粘连,所有的蛋白条带都扭曲变形。因为增加上样量最多只能提高几倍,而WB灵敏度是以10的几次幂量级的,增强目的蛋白信号的唯一方案就是IP富集(可特异提高目的蛋白浓度数百数千倍,并去除其它杂蛋白干扰)。增加上样量的另一个坏处是,本来高表达的蛋白,诸如内参,在同样WB条件下,可能出现荧光灼烧式粹灭(一晃而灭)或者条带中空。
5.如果第二天实验时间比较紧张可提前将SDS PAGE胶配好,放于大的自封袋中,将空气赶出并封死,放于4℃过夜。(关于这点,网上众说纷纭,也有说放于常温即可,4℃低温可能导SDS析出,不过经过实践检验,我们的做法并无大碍)
6.在跑长时间的电泳时,电泳往往会产生大量的热量,这时要想办法给胶散热,否则条带变形。
三、转印
转印可分为湿转和半干转,本实验室采用的是半干转,下面的描述主要是针对的是
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