生命と情報-KyotoUniversityBioinformaticsCenter.ppt

* * * * * * * * 立体構造予測におけるブレークスルー スレッディング法の発明(Eisenberg et al., 1991) 構造既知の配列と類似性が無い配列の構造予測 PSI-BLASTの開発(Altschul et al, 1997) プロファイルに基づくマルチプルアライメントの繰り返し実行によるスレッディング David Baker による ab initio 予測(1997) 統計情報＋シミュレーション 立体構造予測コンテスト：CASP CASP (Critical Assessment of Techniques for Protein Structure Prediction) ブラインドテストにより予測法を評価 半年以内に立体構造が実験により決定する見込みの配列（数十種類）をインターネット上で公開 参加者は予測結果を送付 構造決定後、正解とのずれなどを評価、順位づけ CASPの経過と結果の公表 CASP1 (1994), CASP2(1996), CASP3(1998), CASP4(2000), CASP5(2002), CASP6(2004), CASP7(2006), CASP8(2008), CASP9(2010) CAFASP(1998,2000,2002,2004,2006) 完全自動予測法の評価 結果の公表 会議 ホームページ / 学術専