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MPI-2011-03-02_880006259

计算科学与工程中的 并行编程技术 Parallel Programming Technology in Computational Science and Engineering 都志辉 清华大学计算机系 Email :duzh@ Phone:/~duzh 关于作业 并行的好处 并行的开销(代价) 并行需要解决的主要问题 基本的MPI编程技术 主要内容 基本概念 基本通信语句 编程示例 第一部分 基本概念 关于并行程序 基本特点是什么? 可以支持或者刻画并行/并发执行 并行程序是否一定需要并行机的支持才可以运行? 可以模拟并行的结果(A=B) 串行程序如何并行执行? 自动并行化(软件-编译器,硬件-CPU) 手工并行化改造-并行程序 串行和并行程序相互转换的基础 从应用的角度看效果相同 并行编程的必要性? 自动并行的有限性(有限的性能,有限的范围) 单一硬件单元性能提高的有限性(物理极限) 多核发展趋势 并行需要解决的关键问题 通信 通信中断 通信的核心与枢纽地位 什么是SPMD程序 一个静态的源程序,描述各个进程的综合行为 多个动态的执行进程,只有在运行时才能表现出不同的行为 什么是MPI (Message Passing Interface) 通俗的说法:提供一个大任务各个子任务之间进行信息交流的方式和方法 专业的说法: 消息传递编程模型 消息传递编程标准 消息传递编程库 MPI的消息 作用 定义了MPI通信的方式与表示方法 有助于实现移植性 组成 消息信封 消息内容 MPI消息的目和源 目(Destination) 消息的接收者 源(Source) 消息的提供者 隐含目/源 组通信 MPI消息的标识TAG 作用 区别同一进程的不同消息 P36图18 隐含TAG 组通信,由通信语句的序列决定消息的匹配 消息内容 内容(data),在组通信中有变化形式 起始地址,数据个数,数据类型 必要? 起始地址,长度? MPI的数据类型 定义 一个或多个,相同或不同的基本数据类型,以连续或不连续的方式形成的一种排列 目的:移植,方便使用(抽象,不连续数据的传送) MPI是强数据类型的 整型与实型匹配? MPI提供的三种通信方式 点到点通信(Point to Point) 有且仅有两方(发送方和接收方)参与 双方必须有匹配的消息信封和通信语句 组通信(Collective) 组内所有进程都参与才能完成 各进程的调用形式都相同 常见问题 有的调用,有的不调用(主进程广播,从进程没有广播) 广播语句和接收语句对应 调用参数不对 MPI的进程 MPI通信的对象 MPI并行的单位 MPI进程的标识 区别不同的进程 第二部分 基本的通信语句 注意的问题 语句对应(发与收必须一一对应) 数据类型匹配(严格匹配) 目和源要对应 发方=接收方之源,收方=发送方之目 TAG要匹配 必须匹配 接收语句的特殊性 MPI_ANY_SOURCE, MPI_ANY_TAG FORTRAN和C调用形式的不同 组内共有多少人? 获取给定组的大小:MPI_COMM_SIZE(comm,size) 作用? 编写通用的MPI程序 使程序适合不同个数的进程 第三部分 编程示例 运行结果 完全相同的语句,不同的执行结果 不同进程输出语句的次序是任意的 注意 C和FORTRAN调用形式的不同 大小写的不同 参数的不同 SPMD程序只需要一个源程序 SPMD程序是多进程并行执行 每个进程都执行相同源程序的语句 不同进程的执行结果是不同 if (my_id == 2) { idx = 1; #ifdef DEBUG fprintf(stdout, %d start recv from %d\n, my_id, idx); fflush(stdout); #endif MPI_Recv (r, 1, MPI_INT, idx, 0, MPI_COMM_WORLD, status ); fprintf(stdout, %d finished recv (%d) from %d\n, my_id, r, idx); fflush(stdout); } #ifdef DBUG fprintf(stdout, %d Done ....\n,my_id); fflush(stdout); #endif MPI_Finalize(); return 0; } /* A report was made that this program hung on a

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