生物信息学基础—第三章.ppt

经验法则（针对蛋白质序列）： ① 如果两个序列的长度都大于100，在适当地加入空位之后，它们配对的相同率达到25%以上，则两个序列相关； ② 如果配对的相同率小于15%，则不管两个序列的长度如何，它们都不可能相关； ③ 如果两个序列的相同率在15%?25%之间，它们可能是相关的。 喜敷砒磅首毗审楞廷司辽悉咕抓言涅庐贴郭普转返粹糯隐箭功怕喇傻整搏生物信息学基础——第三章生物信息学基础——第三章 第三节 序列多重比对 多序列比对的定义 设有k个序列s1, s2, ... ,sk，每个序列由同一个字母表中的字符组成，k大于2。通过插入操作，使得各序列达到一样的长度。 操盼锻蚂卢骄赫沼坞佛挂唐攘弄焕娶钵缎锭蹦叛默偷答斧庐未佑袁宇章沫生物信息学基础——第三章生物信息学基础——第三章 多序列比对的目的 发现多个序列的共性 发现与结构和功能相关的保守序列片段 镁翰可锯雾间白逝贯颖油桂粉钎返帘澳汕主玛丸葵盈趴廖歉吕海睬伴丫挠生物信息学基础——第三章生物信息学基础——第三章 多序列比对的应用 研究蛋白质之间的关系 研究一个家族中的相关蛋白质 研究相关蛋白质的保守区域 研究蛋白质的结构和功能 进行蛋白质结构预测 推测各个序列的进化历史 经疼止辆公莲郴眨郴茹沙锑促皆脏丈厚氰刘静补奥援针曼苏天员沥穆贼勒生物信息学基础——第三章生物信息学基础——第三章 二业瞬遣郧擅仿吸试锄酌趟秩角竣喊姨扶诲椿