海岛棉与陆地棉纤维C4H1基因克隆及表达分析
曹佳强1,2,吕淑萍2,李波2,杨洋2,张经博2,谢丽霞2,胡文冉2,范玲(
(1新疆农业大学农学院乌鲁木齐830052;2新疆农业科学院核所乌鲁木齐830091)
摘要:【目的】比较研究海岛棉与陆地棉纤维不同发育时期C4H1基因的表达和结构差异。【方法】分别从海岛棉和陆地棉纤维中克隆C4H1基因的cDNA全长,并利用DNAMAN、MEGA3.1等软件进行C4H1基因的生物信息学分析;采用半定量和实时荧光定量PCR方法,比较海岛棉和陆地棉不同发育时期的棉纤维中C4H1基因的表达水平。【结果】C4H1基因在海岛棉与陆地棉纤维发育不同时期表达具有差异,海岛棉中该基因的表达高峰期在20 DPA,而陆地棉中该基因的表达高峰期在15 DPA。该基因的核酸序列在两种棉花中存在差异,并导致其编码蛋白的氨基酸序列也存在差异,且海岛棉C4H1蛋白中Thr(苏氨酸)含量高于陆地棉,蛋白等电点也要高于陆地棉。【结论】海岛棉中C4H1基因的表达高峰期晚于陆地棉,两个棉种C4H1蛋白氨基酸序列的差异可能导致其理化性质及生物学功能的改变,该研究为发掘海岛棉纤维品质优异基因奠定了基础。
关键词:陆地棉;海岛棉;基因克隆;纤维品质;基因表达
C4H1 Gene Cloning and Expression Analysis between Sea-island Cot
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