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实习四：多序列比对（Multiple alignment） 学号姓名专业年级实验时间提交报告时间实验目的： 1. 学会利用MegAlign进行多条序列比对 2. 学会使用ClustalX、MUSCLE 和T-COFFEE进行多条序列比对分析 3. 学会使用HMMER进行HMM模型构建，数据库搜索和序列比对 实验内容： 多序列比对是将多条序列同时比对，使尽可能多的相同（或相似）字符出现在同一列中。多序列比对的目标是发现多条序列的共性。如果说序列两两比对主要用于建立两条序列的同源关系，从而推测它们的结构和功能，那么，同时比对多条序列对于研究分子结构、功能及进化关系更为有用。例如，某些在生物学上有重要意义的相似区域只能通过将多个序列同时比对才能识别。只有在多序列比之后，才能发现与结构域或功能相关的保守序列片段，而两两序列比对是无法满足这样的要求的。多序列比对对于系统发育分析、蛋白质家族成员鉴定、蛋白质结构预测、保守模块的搜寻以及PCR引物设计等具有非常重要的作用。 作业： 1.Align the orthologous nucleotide and protein sequences from 5 organisms you found from first practice with MegAlign. Describe the sequences you used the ti