真核生物的基因表达调控幻灯片.pptVIP

真核基因组结构特点 真核基因组结构庞大：3×109bp、染色质、染色体、核膜 单顺反子(monocistron) 含有大量重复序列　 基因不连续性：断裂基因（interrupted gene）、内含子(intron)、 外显子(exon) 非编码区多于编码序列(9:1) 多层次调控 亮氨酸拉链(leucine zipper) 螺旋-环-螺旋 翻译起始因子(eIF2)的调控 反式作用因子结构域的模式 （一）DNA结合结构域(DNA- banding domain) 锌指结构(zinc finger motif) 同源结构域(homodomain,HD)：螺旋-转角-螺旋(helix-turn-helix domain) 亮氨酸拉链结构 (leucine zipper) 螺旋-环-螺旋(helix-loop-helix,HLH) 碱性α螺旋(alkaline α-helix) 锌指结构域The zinc finger domain 锌指结构有2种形式： C2H2 zinc finger和C4 zinc finger C2H2 zinc finger：由12个氨基酸组成的环，通过2个半胱氨酸（C，Cys）和2个组氨酸（H，His）残基固定，这4个残基与Zn2+在空间上形成一个四面体结构。 一般情况下需要3个或更多的C2H2型锌指才能与DNA结合，如在TFIIA有9个重复，转录因子SP1有3个重复。 C4 zinc finger： Zn2+与4个半胱氨酸（C，Cys）结合，存在于类固醇激素受体转录因子中。 β-折叠 α-螺旋 半胱氨酸Cys 半胱氨酸Cys 碱性保守氨基酸 组氨酸His The zinc finger domain 锌指结构域 半胱氨酸 组氨酸 β-折叠 α-螺旋 The helix-turn-helix domain 螺旋-转角-螺旋结构域 特点： DNA结合蛋白包含有60个氨基酸的同源域（ Homeodomain），由同源框序列编码（homeobox）。 果蝇的DNA结合结构域由4个-helices（螺旋）组成，螺旋Ⅱ和 Ⅲ保持了适当的角度，并被一个特异的 β-turn（转角）所分隔。 这些结构域在λ噬菌体的Cro阻抑物、乳糖、和色氨酸阻抑物中存在。也存在与真核生物中，包括人类。 α识别螺旋处于DNA的大沟中，并与DNA发生作用 两个同源域因子Bicoid and Antennapedia 的识别螺旋可以互换，也就交换了他们的DNA结合特性。 亮氨酸拉链(leucine zipper) 结构域 （1）富含碱性的氨基酸残基 （2）通常与亮氨酸拉链或H LH（helix-loop-helix)基序中的一个联合在一起，称为碱性亮氨酸拉链（bZIP）或碱性H LH 蛋白 （3）蛋白的二聚作用使2个碱性结构域相邻，进而可与DNA发生作用。 螺旋-环-螺旋结构域 The helix-loop-helix domain，HLH结构域。如：Myo D 蛋白。 可变连接区 DNA特异位点 DNA特异位点 DNA特异位点 (1)酸性激活结构域 Acidic activation domains 酵母Gcn4 和Gal4、哺乳动物糖皮质激素受体、疱疹病毒激活子的转录激活结构域均含有高比例的酸性氨基酸，称为酸性激活结构域 (2)富含脯氨酸结构域 Prolin-rich domain 在c-Jun、AP2和OCT-2等转录因子中发现富含脯氨酸结构域 ，这个结构域可以激活转录。 (3)富含谷氨酰胺结构域 Glutamine-rich domains 在SP1转录因子的2个激活区域上发现富含谷氨酰胺结构域，这些结构域与果蝇触角蛋白质的结构域可以互换。 反式作用因子结构域的模式（续） （二）转录激活结构域 (transcriptional activation domain) （三）二聚体结构域 Dimerization domains 亮氨酸拉链（Leucine zipper ）的肽链上每隔7个残基就有一个疏水的亮氨酸残基，这些残基位于DNA结合域的C端α-螺旋上，形成一个疏水表面，疏水表面的相互作用，形成了二聚体——卷曲的卷曲结构（coiled-coil structure）如bZIP转录因子。 5′端加帽(cap)和3′端多聚腺苷酸化(polyA)的调控意义 使mRNA稳定，在转录过程中不被降解 mRNA的选择剪接(alternative splicing)对基因表达的调控 外显子选择(optional exon)、内含子选择(optional intron)、互斥外显子、内部剪接位点 mRNA 运输的控制 真核基因转录后水平的调控 翻译水平的调控 5’端UTR