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Pterin, folate, and tetrahydrofolate. Pterin (a) is part of folate (b), a molecule containing p-aminobenzoate (red) and glutamate (blue). (c) The polyglutamate forms of tetrahydrofolate usually contain five or six glutamate residues. The reactive centers of the coenzyme, N-5 and N-10, are shown in red. 2-氨基-4-羟基-6-甲基喋呤啶,对氨基苯甲酸,两者组成喋酸,加上谷氨酸就构成了叶酸。 * * * Figure 7.24 Cobalamin (vitamin B12) and its coenzymes. (a) Detailed structure of cobalamin, showing the corrin ring system (black) and 5,6-dimethylbenzimidazole ribonucleotide (blue). The metal coordinated by corrin is cobalt (red). The benzimidazole ribonucleotide is coordinated with the cobalt of the corrin ring and is also bound via a phosphoester linkage to a side chain of the corrin ring system. (b) Abbreviated structure of cobalamin coenzymes. A benzimidazole ribonucleotide lies below the corrin ring, and an R group lies above the ring. * 上图:Lipoamide(硫辛酰胺). Lipoic acid is bound in amide linkage to the ?-amino group of a lysine residue (blue) of dihydrolipoamide acyltransferases(二氢硫辛酸乙酰转移酶). The dithiolane ring of the lipoyllysyl groups is extended 1.5 nm from the polypeptide backbone. The reactive center of the coenzyme is shown in red. 硫辛酸以闭环二硫化物形式和开链还原形式两种结构混合物存在,这两种形式通过氧化-还原循环相互转换,像生物素一样,硫辛酸事实上常常不游离存在,而是同酶分子中赖氨酸残基的ε-NH2 以酰胺键共价结合。 * * * * * * * * * * * 二 酶的不同形式 单体酶(monomeric enzyme):仅具有三级结构的酶。一般由一条多肽链组成。 寡聚酶(oligomeric enzyme):由多个相同或不同亚基以非共价键连接组成的酶。 多酶体系(multienzyme complex):由几种不同功能的酶彼此聚合形成的多酶复合物。 三 酶的活性中心 必需基团(essential group) 酶分子中氨基酸残基侧链基团中,一些与酶活性密切相关的化学基团。 酶的活性中心(active center) 或称活性部位(active site),指必需基团在空间结构上彼此靠近,组成具有特定空间结构的区域,能与底物特异结合并将底物转化为产物的部位。 活性中心内的必需基团 结合基团(binding group) 与底物相结合 催化基团(catalytic group) 催化底物转变成产物 His Ser Cys Lys Glu Asp 位于活性中心以外,维持酶活性中心应有的空间构象所必需。 活性中心外的必需基团 底 物 活性中心以外的必需基团 结合基团 催化基团 活性中心 酶活性中心的特点 1、活性中心在酶分子的总体中只占相当小的部分,通常只占整个酶分子体积的1%~2%。 某些酶活性部位的AA残基 酶 AA残基数 活性部位的AA残基 核糖核酸酶 124 His12, His119
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