RNA二级结构的分析.ppt

RNA二级结构的分析 RNA是一条单链，X射线衍射已经证明，RNA的许多区域自身发生回折使许多配对的碱基相遇想形成茎环结构，不能配对的则形成突环结构，约40%-70%的核苷酸形成上述结构。所以RNA是含短的不完全的螺旋区多核苷酸链。 常见的一些RNA二级结构预测软件 RNA分析类 ??????????? RNA draw 1.1 b2 RNA draw 1.1b2 RNA二级结构分析软件。 RNAstructure 5.6 Unix平台软件mfold的java版本。 RnaViz 2.0 界面友好的RNA二级结构图绘制程序。可生成发表质量的二级结构图，可显示一些特殊结构。 loopDloop 2.07b Java语言写成的绘制RNA二级结构的软件，需要安装JAVA虚拟机。 Circles 0.1.1 使用比较的方法分析RNA二级结构软件，并以标准格式输出预测的二级结构。 SStructView 1.2 用JAVA脚本语言写成的RNA二级结构显示软件。 Vienna RNA Package 2.1.6 维也纳大学RNA二级结构预测与比较软件包。 XRNA 1.2.0b 基于java的生成、显示、注释RNA二级结构的软件，可很容易地编辑、修改、生成发表质量的RNA二级结构图。 PseudoViewer 3.0 RNA二级结构显示软件。 OligoEngine