人类基因组学与基因组计划课件.ppt

三、比较基因组学（comparative genomics） 各种模式生物基因组序列的比较 生物种类 基因组大小 预测基因组数目 基因平均长度 大肠杆菌 4.6Mb 1800 约1kb 酵母 12Mb 5800 约2kb 秀丽线虫 97Mb 18500 约5.3kb 果蝇 116Mb 13600 约10kb 小鼠 3000Mb 40000 约30kb 人 3164Mb 30000-40000 27kb 生物基因组进化的连续性分析 21%的基因原核生物和真核生物共有 32%的基因真核生物共有而原核生物没有 24%的基因动物所共有 22%的基因脊椎动物特有 四、环境基因组学（enviromental genomics） 是研究与环境因素相关的疾病易感性基因的。环境相关的疾病易感基因 基因多态性 分类 环境成份 相关疾病 CYP1A1 激活 吸烟 肺癌 GST 解毒 吸烟 肺癌 NAT2 解毒 吸烟 膀胱癌、乳腺癌 TCF2 转录因子 母亲吸烟 唇裂、腭裂 ALAD 生物合成 铅 铅中毒 五、疾病基因组学（morbid genomics） 主要任务是分离重要疾病的致病基因与相关基因，并确定其致病机制。1.肿瘤癌基因和抑癌基因的定位与克隆；2.单基因病致病基因的定位与克隆；3.多基因病数量性状基因座（QTL）的定位与克隆。 六、药物基因组学（pharmacogenomics） 是研究药物及化学物质引起机体反应上的遗传差异，即药物多态性的学科，以便能更安全有效的使用药物，和发现新的药物。 七、生物信息学（bioinformatics） 是生物学与计算机科学和应用数学交叉的一门新兴学科，对生物学实验数据的获取、加工、存储、检索与分析，进而达到揭示数据所含的生物学意义有重要作用。 国际上三大公共基因数据库：  Gene Bank：美国国家生物技术信息中心（NCBI） EMBL：美国欧洲生物学信息研究所（EBI） DDBL：日本信息生物学中心（CIB） 生物信息学已改变了基础生命科学研究的运作方式，极大地提高了工作效率。 第四节 基因定位与克隆 基因定位（gene mapping） 就是用一定方法，将各个基因确定到染色 体的实际位置。 基因克隆（gene cloning） 是从基因组中把某一基因用一定方法分离出来，以便进行单一基因精细结构和功能的研究。 一、基因定位 工作历史 主要方法 连锁分析（linkage analysis） 体细胞杂交（somatic cell hybridization） 原位杂交（hybridization in situ） 放射杂种（radiation hybrid） 计算机识别（computer identification） 1．连锁分析 同一条染色体上的不同基因呈线性连锁关系，在减数分裂后，结合家系分析，可鉴定子代中的重组体，通过重组值计算，可推断待定位基因与已定位基因间的连锁关系和遗传距离，而实现基因定位。 两个基因如非连锁，则重组值=50%，即随机组合。 减数分裂 产生配子 发生交换 A b a B A b a B A B A B a b a b a b a B A B A b 两个基因如连锁，则重组值＜50%，且重组值与遗传距离成正比。 体细胞杂交 人/鼠融合细胞的特点： 融合细胞兼有有双亲细胞染色体，但鼠一方染色体一般全部保留，而人一方染色体在细胞增殖过程中优先丢失，以至最后仅剩少数几条，乃至1条人染色体是基因定位的好材料。结合染色体显带和生化分析技术，可把某些生化性状决定基因定位在保留的一条染色体上。 杂种细胞克隆嵌板 杂种克隆 保留的人类染色体 1 2 3 4 5 6 7 8 A + + + + － － － － B + + － － + + － － C + － + － + － + － ?3.原位杂交 是核酸分子杂交技术在基因定位中的应用。用经放射性同位素标记的探针，同染色体标本载玻片上原位变性的染色体DNA进行分子杂交，通过放射自显影来检测与探针杂交结合的染色体同源序列，依据放射性探针在染色体上的显影位置进行基因定位。 荧光原位杂交（FISH） 4.放射杂种 是用射线辐射人体细胞染色体，使其随机片段化，再与鼠细胞融合，形成人/鼠细胞放射杂种，人的随机染色体片段，整合入鼠细胞染色体中。构建放射杂种细胞系克隆嵌板，可用于基因定位。 二、基因克隆 基因克隆的三种策略： 功能克隆（func