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- 2017-01-02 发布于贵州
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A题 血管的三维重建
摘要
对于血管的三维重建问题,关键是找出理论假设下血管的中轴线和血管的直径。通过这两个参数的确定就可以基本上绘制出血管图来。
首先,对给出的100张血管断面的二进制图像进行取反操作,应用软件获得图片中血管图像内部点和边缘点的坐标,根据程序求得最大内切圆的半径及其圆心坐标。具体是(1)求出内部任意一点与边缘点的距离,取距离最小的值作为以该点为圆心的内切圆半径;(2)在这些半径中找到数值最大的值即为该图像的最大内切圆半径,对应的点坐标即为最大内切圆的圆心坐标。对所有求得的半径取平均值得到。
然后,根据100个圆心坐标进行多项式曲线拟合,得到中轴线方程为:
剩余标准差为1.5518,说明此回归模型的显著性好。
绘制出曲线图,并投影到X-Y,X-Z,Y-Z坐标面上。
关键词:边界提取 最大内切圆法 多项式拟合
1 问题重述
断面可用于了解生物组织、器官等的形态。例如,将样本染色后切成厚约的切片,在显微镜下观察该横断面的组织形态结构。如果用切片机连续不断地将样本切成数十、成百的平行切片, 可依次逐片观察。根据拍照并采样得到的平行切片数字图象,运用计算机可重建组织、器官等准确的三维形态。
现有某管道的相继100张平行切片图像,记录了管道与切片的交。图像文件名依次为0.bmp、1.bmp、…、 99.bmp,格式均为BMP,宽、高均为512个象素(pixel)。
试计算管道的中轴线与半径,给出具体的算法,并绘制中轴线在X-Z、Y-Z、X-Y平面的投影图。
2 模型假设
(1)血管可视为一类特殊的管道,该管道的表面是由球心沿着某一曲线(称为中轴线)的球滚动包络而成;
(2)球半径固定;
(3)管道中轴线与每张切片有且只有一个交点;
(4)图片间距以及图像像素尺寸均为1。
3 符号说明
:切片数,从0到99。
:切片图像最大内切圆圆心范围坐标。
:切片图像边缘点的坐标。
:切片图像的最大内切圆半径。
:切片图像最大内切圆圆心的横坐标。
:切片图像最大内切圆圆心的纵坐标。
:从(-9,-9)点到(10,10)点矩形范围内所有横、纵坐标为整数的点。
:切片图像中任意一点到的最短距离
4 问题分析
本题给出了某管道的相继100张平行切片图像,记录了管道与切片的交。由于该血管是由球心沿着某一曲线的球滚动包络而成,且球的半径固定。图像格式均为BMP,宽、高均为512个象素(pixel),图像象素的尺寸为1,对图像进行取反操作,一是函数求解需要,二是得到最大内切圆半径为图像内部球体半径更符合要求。所以我们得到以下两个结论:(1)每张图片图形的最大内切圆的半径即为滚动球体的半径;(2)圆心坐标即为滚动球体的球心坐标,由于切片间距也为1,故可以得到滚动球体的三维坐标。
根据每张图片最大内切圆的圆心拟合出管道的中轴线,并绘制出来,将绘制出的中轴线分别投影到X-Y、Y-Z、Z-X平面即可得到中轴线在X-Y、Y-Z、Z-X平面的投影图。
5模型建立与求解
首先用画图板对100张图片取反色,然后导入到matlab中。
求得切片图像边缘点坐标及第一张切片图像的内部点坐标;
求中任意一点到的最短距离;
在中取最大值即为第一张切片图的最大内切圆半径,对应的内的一点的坐标即为最大内切圆的圆心坐标(,);
求下一张图像的最大内切圆圆心范围;
求中任意一点到的最短距离;
在中取最大值即为第Z张切片图的最大内切圆半径,对应的内点的坐标即为最大内切圆的圆心坐标(,);
检验所求圆心是否在原来预计的圆心范围内。
若不符合与
则 令 返回到(5)
利用上面得到的中心点坐标通过Matlab拟合出中轴线方程,并绘制出。
求得的最大内切圆半径和圆心坐标见附录表一。
通过对100个最大内切圆半径求平均值,得到。
利用matlab多项式拟合函数polyfit程序五进行三维曲线的拟合,得到中轴线方程为:
剩余标准差为1.5518,数值小,说明此回归模型的显著性好。
中轴线三维图为:
图一 中轴线三维图
中轴线X-Y面上的投影:
图二 中轴线X-Y面上的投影
中轴线X-Z面上的投影:
图三 中轴线X-Z面上的投影
中轴线Y-Z面上的投影:
图四 中轴线Y-Z面上的投影
6 模型检验
画出由图片信息绘制三维点图程序,根据求得中轴线和半径绘制三维血管图。
实际血管切片图像边缘包络出的血管图在各个坐标面上的投影:
图五 实际血管X-Y平面投影
图六 实际血管X-Z平面投影
图七 实际血管Y-Z平面投影
通过球体沿着中轴线滚出的血管图在各个坐标面上的投影:
图八 理论血管X-Y平面投影
图九 理论血管X-Z平面投影
图十
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