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表达序列标签(EST)测定及分析 张宏 Outline 1、什么是EST? 2、EST的应用 3、EST序列测定及分析过程 4、实例：家猪脑组织及甲状腺EST分析 什么是 ESTs ？ ESTs（Expressed Sequence tags ）是从已建好的cDNA库中随机取出一个克隆，从5’末端或3’末端对插入的cDNA片段进行一轮单向自动测序，所获得的约60-500bp的一段cDNA序列。 大规模EST序列测定的开始 ESTs的来源 上世纪80年代，对cDNA序列进行大规模测序的想法就曾提出，但对此一直存在争论，有人认为这种方法能发现成千上万的新基因；而反对者则认为cDNA序列缺少重要的基因调控区域的信息。90年代初Craig Venter 提出了EST的概念，并测定了609条人脑组织的EST，宣布了cDNA大规模测序的时代的开始 (Adams et al.,Science,1991)。 　 ● ● 1993年前ESTs数据收录于GenBank， EBI和DDBJ。 ● 1993年NCBI(National Center of Biotechnology Information)建立了一个专门的EST数据库dbEST来保存和收集所有的EST数据。 ● 1995年中期GenBank 中EST的数目超过了非EST的数目。 ● 至2007年9月底，GenBank