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碱基符号 生物信息学中常用的18个碱基字母 字母 碱基 全称 说明 单碱基 A A Adenine 腺嘌呤 ? C C Cytosine 胞嘧啶 ? G G Guanine 鸟嘌呤 ? I I Isosine 次黄嘌呤 ? T T Thymine 胸腺嘧啶 ? U U Uracil 尿嘧啶 二碱基 K G/T Keto 含酮基 ? M A/C aMino 含氨基 ? R A/G puRine 嘌呤 ? S G/C Strong pair 强配对 ? W A/T Weak pair 弱配对 ? Y C/T pYrimidine 嘧啶 三碱基 B C/G/T Not A 非A ? D A/G/T Not C 非C ? H A/C/T Not G 非G ? V A/C/G Not U (or T) 非U(T) 四碱基 N A/C/G/T Any 任一碱基 ? X A/C/G/T Unknown 未知碱基 氨基酸 ?? 名称 Name 简写 密码子 分子量 残基 A3 A2 ml/g 丰度 pI pKa 亲水 疏水 侧链 A 丙氨酸 alanine Ala GCX ? 89.09 ? 71.08 ? 88.6 115 748 7.55 6.0 ? ? 0.45 ? 0.5 -CH3 C 半胱氨酸 cystine Cys TGM 121.15 103.14 108.5 135 631 1.69 5.0 9.3 ? 3.63 -2.8 -CH2SH D 天冬氨酸 asparic acid Asp AAM 132.12 114.11 117.7 160 619 4.52 5.4 ? 13.31 -7.4 -CH2CONH2 E 谷氨酸 glutamic acid Glu GAP 147.13 129.12 138.4 190 643 6.32 ? ? 12.58 -9.9 -CH2CH2COO- F 苯丙氨酸 phenylalanine Phe TTM 165.19 147.18 189.9 210 774 4.07 5.5 ? ? 3.15 2.5 CH2(C6H5) G 甘氨酸 glycine Gly GGX ? 75.07 ? 57.06 ? 60.1 ? 75 632 6.84 6.0 ? ? 0 ? 0 -H H 组氨酸 histidine His CAM 155.16 137.15 153.2 195 670 2.24 ? ? 12.62 ? 0.5 -CH2(C3N2H4)+ I 异亮氨酸 isoluecine Ile ATM,ATA 131.17 113.17 166.7 175 884 5.72 ? 6.2 ? 0.24 ? 2.5 -CH(CH3)CH2CH3 K 赖氨酸 lysine Lys AAP 146.19 128.18 168.6 200 789 5.93 ? ? 11.91 -4.2 -(CH2)4NH3+ L 亮氨酸 luecine Leu CTX,TTP 131.17 113.17 166.7 170 885 9.33 6.0 ? ? 0.11 1.8 -CH2CH(CH3)2 M 蛋氨酸 methionine Met ATG 149.21 131.21 162.9 185 745 2.35 5.8 10.4 ? 3.87 1.3 -(CH2)2SCH3 N 天冬酰胺 asparagine Asn GAM 133.10 115.09 111.1 150 579 5.30 ? 4.5 12.07 -0.2 -CH2COO- P 脯氨酸 proline Pro CCX 115.13 ? 97.12 122.7 145 758 4.92 6.3 ? ? -3.3 -(CH2)3- Q 谷氨酰胺 glutamine Gln CAP 146.15 128.14 143.9 180 674 4.02 5.7 4.6 11.77 -0.3 -CH2CH2CONH2 R 精氨酸 arginine Arg CGX,AGP 174.20 156.20 173.4 225 666 5.15 ? ~12 22.31 -11.2 -(CH2)3CH(NH2)+NH2 S 丝氨酸 serine Ser TCX,AGM 105.09 ? 87.08 ? 89.0 115 613 7.22 5.7 ? ? 7.45 -0.3 -CH2OH T 苏氨酸 threonine Thr ACX 119.12 101.11 116.1 140 689 5.74 6