全面的质粒抽提纯化疑难解答..docVIP

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  • 2016-12-26 发布于重庆
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全面的质粒抽提纯化疑难解答 来源:生兴生物 质粒抽提该实验成功的标志是去除RNA,将质粒与细菌基因组 DNA分开,去除蛋白质及其它杂质,得到相对纯净的质粒。 图:质粒大量抽提 1.常用试剂1)溶液I:EDTA:螯合Mg2+、Ca2+等金属离子,抑制脱氧核酸酶对DNA的降解作用(DNase作用时一定的金属离子作辅基)。有利于溶菌酶的作用,因为溶菌酶的反应要求有较低的离子强度的环境。 (2)溶液II: 新鲜NaOH /SDS。新鲜III:醋酸钾(KAc)缓冲液KAc:用pH4.8的KAc溶液是为了把pH12.6的抽取液pH调回到中性,使变性的质粒DNA能够复性,并能稳定存在。而高盐的3mol∕L KAc有利于变性的大分子染色体DNA、RNA以及SDS-蛋白质复合物凝聚而沉淀之。前者是因为中和核酸上的电荷。减少相斥力而互相聚合,后者是因为钠盐与SDS-蛋白质复合物作用后,能形成溶解度较小的钠盐形式复合物,使沉淀完全。 (4)苯酚/氯仿/异戊醇:沉淀蛋白质。酚与水有很大的互溶性,如果单独用酚抽提后会有大量的酚溶解到水相中,而酚会抑制很多酶反应(比如限制性酶切反应),因此如果单独用酚抽提后一定要用氯仿抽提一次将水相中的酚去除。异戊醇其作用主要是为了让离心后上下层的界面更加清晰,也方便了水相的回收。 (5)乙醇:沉淀质粒DNA。此为实验中最常用的沉淀方法。DNA溶液时以水合状态稳定

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