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第一章:
绪论
分子生物学狭义和广义概念
分子生物学作为所有生命物质的共性学科所遵循的三大原则:1)构成生物大分子的单体是相同的(共同的核酸语言(Nt) ,共同的蛋白质语言(aa))2)生物遗传信息的表达的中心法则相同 3)生物大分子单体的排列(核苷酸,氨基酸)决定了生物性状的差异和个性特征。
生物学的三大发现:DNA 双螺旋结构的揭示、遗传密码子的破译以及信使RNA 的发现,奠定了DNA-RNA-蛋白质三者之间关系的基础。
第二章:基因概念的演变与发展
1、遗传学家摩尔根根据对果蝇的遗传试验提出了基因是:基因像念珠(bead)一样孤立地呈线状一样排列在染色体上,是具有特定功能、能独立发生突变和交换的、“三位一体”的、最小的遗传单位。
2、科学家们通过对噬菌体突变体与表型之间的关系的研究,提出了顺反子理论:
顺反子是基因的同义词,认为基因是一个具有特定功能的、完整的、不可分割的最小遗传单位。在一个基因内可以发生突变、重组(交换)。
3、DNA是遗传的主要物质,它以两种方式携带遗传信息。1)以中心法则为基础的结构基因遗传信息。2)调控基因选择性表达的遗传信息,通过特地个DNA序列与特定的蛋白质或核酸的相互作用,开启或关闭某些基因的表达。4
4、DNA作为遗传物质的优点:贮存遗传信息大;双螺旋结构稳定,利于复制,便于转录;可以突变,以求不断地进化,方便修复以求稳定遗传;核糖2’-OH脱氧,使DNA在水中的稳定性高于RNA。
5、RNA分子与DNA分子在结构上的主要差异在:1)核苷中的核糖为2’非脱氧的OH基。2)碱基中没有T,只有U。3)RNA分子多为单链分子。4)RNA分子的化学稳定性差,易发生降解。5)在以DNA为主要遗传物质的生物中,DNA分子链长,数目少,而RNA分子链短,数目多。
DNA双链的特点:1)每一条单链具有5ˊ→3ˊ极性,两条单链极性相反,反向平行。2)两条单链之间以氢键相互作用。3)B-螺旋右手螺旋。4)存在大沟与小沟。
6、DNA双螺旋大沟的具有比较重要的生物学功能:
影响双螺旋结构稳定性的因素:氢键、磷酸酯键,生理条件下。Na离子可有效地屏蔽两条主链上磷酸基团的静电排斥力,碱基堆积力。
DNA的变性与复性:两条单链间氢键的断裂和重新形成。d.s.DNA →s.s.DNA溶液粘性降低,沉降速度加快 d.s.DNA→s.s.DNA 260nm处吸光度值上升
增色效应 (Hyperchromycity)。
9、变性温度:DNA双链在一定的温度下变成单链,将开始变性的温度至完全变性的温度的平均值称为DNA的变性温度。变性温度与以下因素有关:1)DNA分子的碱基组成和排列方式。2)对于较大的DNA 分子,片段长短对Tm值的影响较小。较小的DNA分子(小于100 bp),片段较短的Tm值小。3)变性剂的影响,通常有机溶剂分子,破环DNA分子的氢键,使Tm值降低。4)随着盐浓度的增加,Tm值增加。5)溶液的PH值。过酸或过碱的环境,均导致Tm值降低。
10、DNA的复性:
11、影响DNA复性过程的因素:1)阳离子浓度0.18~0.2M Na+可消除poly-dNt间的静电斥力,促进配对。2)复性反应的温度Tm-25℃可消除S.S. DNA分子内的错误局部配对和二级结构。3)S.S. DNA分子的长度S.S. DNA分子越长,扩散速度越慢,复性越慢4) S.S. DNA分子越短,扩散速度越快,复性越快。5)S.S. DNA分子的初始浓度。6)DNA分子中核苷酸的排列或核苷酸的复杂性重复排列序列的DNA分子较随机排列的复性速度更快。
12、在不同的生理条件下,DNA可能采取不同的二级结构形式,除了典型的B-DNA结构类型外,尚有A-DNA,Z-DNA。它们与B-DNA的主要区别是,没有明显的大沟与小沟。Z-DNA区的基因通常是不表达的。
13、除了正常的DNA双螺旋,在基因组中的DNA还有可能呈现三股螺旋和四股螺旋状态。三股螺旋DNA可能是分子内、分子间和平行三股螺旋。它具有的生物学意义:是阻止了调节蛋白与DNA序列的结合,关闭基因的表达。与重组交换有关。可作为分子剪刀,定点切割DNA;可能与RNA形成三股螺旋,是RNA参与基因表条调控的机制之一(P43)(Hoogsteen 氢键)
14、尽管到目前为止,尚未在体内发现四股螺旋,但根据真核生物着丝粒区和染色体末端序列的特点,均有形成四股螺旋的可能。所以他们可能具有比较重要的生物学功能。(如维持线性染色体末端的稳定性,与染色体的有丝分裂和减数分裂有关等)。
15、C值与C值悖论
16 、重叠基因
17、重复基因(?)
18、间隔基因(断裂基因),断裂基因概念的相对性,生物学意义。P63-64
内含子也可编码蛋白
外显子不一定编码氨基酸序列
有些真核基因
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