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散发性结直肠癌中CpG岛甲基化表型研究及其与微卫星不稳定的关系
[摘要] 目的 研究散发性结直肠癌(SCRC)中CpG岛甲基化表型(CIMP)阳性的发生率及其临床病理特征,并探讨其与微卫星不稳定(MSI)的关系。 方法 采用甲基化特异性PCR(MSP)方法对91例散发性结直肠癌患者行P16、hMLH1、MINT1、MINT2和MINT31共5个基因启动子甲基化检测,分析散发性结直肠癌中CIMP阳性病例的临床病理特征。同时应用荧光标记多重PCR法扩增两个微卫星位点BAT25和BAT26,分析两个微卫星位点状况,探讨CIMP与MSI的关系。 结果 91例散发性结直肠癌患者中共检出CIMP阳性者22例,阳性率为24.2%。CIMP阳性者与CIMP阴性者相比,前者好发于近端结肠(P=0.02)、分化程度上低分化癌多见(P=0.03)、组织学类型上黏液腺癌或印戒细胞多见(P=0.04)。27.3%的CIMP阳性病例表现为MSI,54.5%的MSI病例表现为CIMP阳性(P=0.02)。 结论 CIMP的散发性结直肠癌具有好发于近端结肠、低分化癌及黏液腺癌或印戒细胞多见等特点,CIMP与MSI两者具有密切关系。
[关键词] 散发性结直肠癌;CpG岛甲基化表型;微卫星不稳定
[中图分类号] R735.3 [文献标识码] B [文章编号] 1673-9701(2013)26-0051-03
近年来研究揭示DNA启动子异常甲基化是抑癌基因转录失活的重要机制,Toyota等[1]提出CpG岛甲基化表型(CpG island methylator phenotype,CIMP)的概念,用于反映多个抑癌基因的同时异常甲基化状态。微卫星不稳定(microsatellite instability,MSI)是基因组遗传不稳定的一个重要标记,在结直肠癌中MSI已成为筛查遗传性非息肉病性结直肠癌(HNPCC)的重要分子指标[2],但在散发性结肠癌中,有关CIMP与MSI关系的研究国内外报道尚不一致[3,4]。本研究通过检测与结直肠癌密切相关的5个抑癌基因的启动子甲基化状态,研究散发性结直肠癌中CIMP阳性的发生率及其临床病理特征,同时探讨CIMP与MSI的关系。
1 材料与方法
1.1 材料来源
收集浙江省肿瘤医院结直肠外科2009年1~6月份收治的手术切除91例结直肠肿瘤标本。所有病例术前均未行放疗和化疗,并有明确病理诊断,无肿瘤家族史。所有肿瘤标本均于手术切除后15~30 min内取材,并迅速转移至-80℃低温冰箱中保存。
1.2 DNA提取
采用酚/氯仿/异戊醇法提取基因组DNA。
1.3 MSP检测
按文献方法进行DNA的亚硫酸盐处理[5],P16、hMLH1、MINT1、MINT2及MINT31 5个抑癌基因的MSP甲基化及非甲基化引物和反应条件见表1。PCR反应混合物包括:1×PCR buffer[16.6 mmol/L(NH4)2SO4,67 mmol/L Tris(pH 8.8)],dNTP 0.4 mmol/L,MgCl2终浓度2.5 mmol/L,上下游引物各10 pmol,亚硫酸盐处理后的模板DNA(30~50 ng),用ddH2O补足体积至25 μL。95℃预反应5 min后加入热启动Taq酶(Hot-star Taq DNA多聚酶,Qiagen公司)0.75 U,之后94℃变性45 s,退火温度45 s,72℃延伸45 s,35个循环,然后72℃延伸7 min,4℃结束反应。以SssⅠ处理过的DNA(New England Biolabs,Ipswich,MA)作为阳性对照,以蒸馏水为空白对照,PCR产物以3%琼脂糖凝胶电泳,置于紫外线凝胶扫描系统中观察结果。MSP产物电泳时只出现未甲基化条带时为未甲基化,如出现甲基化条带则为甲基化。5个基因中有2个或2个以上基因同时出现甲基化条带者,该样本定义为CIMP阳性[4]。
1.4 MSI检测
选用BAT25和BAT26两个位点,PCR反应后将反应物在ABI PRISM 3730XL DNA测序仪上按仪器说明进行毛细管凝胶电泳,数据由GenScan3.1软件收集后进行分析。如果肿瘤组织DNA出现正常组织DNA没有的峰形判断为MSI。本研究按参考文献将BAT25、BAT26两个位点均为阴性定义为微卫星稳定(MSS),两个位点均为阳性定义为高度微卫星不稳定(MSI-H),单个位点阳性者定义为低度微卫星不稳定(MSI-L)[5]。
1.5 统计学分析
采用SPSS13.0软件分析,比较CIMP阳性者与CIMP阴性者两者的病理特征,并分析5个基因的甲基化及CIMP状态与MSI的关系。采用χ2检验与Fi
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