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- 约 51页
- 2017-01-01 发布于河南
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生物信息学软件及使用概述 刘吉平 liujiping@ 生物信息学的概念: 生物信息学是一门新兴的交叉学科,它将数学和计算机知识应用于生物学,以获取、加工、存储、分类、检索与分析生物大分子的信息,从而理解这些信息的生物学意义。 生物信息学软件主要功能 分析和处理实验数据和公共数据,加快研究进度,缩短科研时间 提示、指导、替代实验操作,利用对实验数据的分析所得的结论设计下一阶段的实验 实验数据的自动化管理 寻找、预测新基因及其结构、功能 蛋白质高级结构及功能预测(三维建模,目前研究的焦点和难点) 功能1. 分析和处理实验数据和公共数据,加快研究进度,缩短科研时间 核酸:序列同源性比较,分子进化树构建,结构信息分析,包括基元(Motif)、酶切点、重复片断、碱基组成和分布、开放阅读框(ORF),蛋白编码区(CDS)及外显子预测、RNA二级结构预测、DNA片段的拼接; 蛋白:序列同源性比较,结构信息分析(包括Motif,限制酶切点,内部重复序列的查找,氨基酸残基组成及其亲水性及疏水性分析),等电点及二级结构预测等等; 本地序列与公共序列的联接,成果扩大。 Antheprot 5.0 Dot Plot 点阵图 Peptool Lite--- Dot Plot 点阵图 DNASIS 2.5 RNA 二级结构预测 DNASIS 2.5 tRNA 二级结构预测 RNAS
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