分子微生物考点(by suguang).docVIP

第一章基因、复制子及基因组 第1节基因概念的发展 经典遗传学关于基因概念的要点： ? 基因是不连续的颗粒状因子，在染色体上有固定的位置，呈直线排列，具有相对稳定性。 ? 基因作为功能单位控制有机体的性状表达。 ? 基因以整体进行突变，是突变的最小单位。 ? 基因是重组的最小单位，在交换中不再分割。 ? 基因能自我复制，在有机体内通过有丝分裂有规律地传递 基因的cistron和operon概念 什么是cistron? 在反式构型中，不能发生互补的各个突变型在染色体上所占的一个区域称为一个顺反子。cistron既有功能上的完整性，又有结构上的可分性。 操纵子（operon）概念： 操纵子（operon）：指包含结构基因、操纵基因以及调节基因的一些相邻基因组成的DNA片段，其中结构基因的表达受到操纵基因的调控。 蛋白质呈反式作用，DNA位点呈顺式作用 起调节作用的DNA 序列称为顺式作用元件。所有基因产物，RNA或蛋白质，都是反式作用因子，可作用细胞内基因的任一拷贝。 在“基因”这一术语中，位于同一条DNA上的位点称为顺式（cis)，位于2个不同DNA分子上的位点称为反式（trans)。互补试验认为，当2个突变以反式存在时，如果其功能不能相互补偿，则这2个突变位于同一基因内。即同一基因内的突变不能互补。 “顺反子”，“互补群”，“基因”都用来描述一段DNA，顺反子是互补试验定义基因的遗传单位。互补群是指互补试验中，不能相互补偿的一系列突变。 如果一个位点起反式作用，它肯定是通过产生可扩散的分子而起作用，这种分子通常是蛋白质，可作用于细胞内的多个靶点。如果一个突变是顺式的，它肯定是以DNA位点形式而不是以蛋白质或RNA形式起作用。 什么是基因？ 基因是一段核苷酸序列（DNA or RNA) 指导合成一种功能性肽链或RNA分子，包括外显子、 内含子等全部序列 是遗传物质最小的功能单位 第2节 基因组概述 基因组（genome）:指生物体活细胞中一套单倍体遗传物质的总合。 C值（C-value)：指单倍体基因组的DNA总量。是生物的重要特征。 如何知道某一基因是否是必需的？ 答案是：通过突变分析来确定。如：插入突变法。 mRNA丰度（ mRNA abundance ):指每一细胞中，每一种mRNA 的平均数量。 如何测定表达基因的数量：RT-PCR；realtimePCR；microarray；SAGE 第3节基因组结构 基因组概念，还包括真核微生物不同DNA分子上的结构分布和排列情况。 Virus genome 的核酸有正负链之分。 ?正链RNA病毒：病毒的ssRNA可以直接作为mRNA,指令合成外壳及核酸，并组装成病毒体。 ?负链RNA病毒：病毒的RNA不能直接作为mRNA。因此，其RNA分子无感染性，需要转录出mRNA才有感染性，但这种转录需要病毒自身的 RNA polymerase ，寄主细胞是不具备的。 ?所以，负链RNA病毒都是以完整的病毒颗粒作为感染单位，才能在寄主内正常的复制及繁殖。 重叠基因的定义： 不同的基因共用一段DNA序列，按照不同的阅读框转录，编码一条以上的多肽链。 ? 思考题： 1、重叠基因图是通过什么方法做出来的？ 2、一条双链DNA片断理论上可以编码多少种氨基酸序列？ 端粒（Telomere）：线形的染色体末端DNA重复序列与蛋白结合的复合体结构。 扩增：染色体某些区段的DNA序列，其拷贝数专一性地大量增加的现象。 AUD和ADS： （1）扩增单位，AUD（amplified unit of DNA）指 DNA扩增的区域。AUD长度通常5~25kb，两端是1~2kb的重复序列。 （2）扩增序列，ADS （amplified DNA sequence）指实际扩增的DNA 序列。ADS是由多个AUD串联而成，可从几个到几百个。 真核基因的着丝粒、端粒和复制起点： 着丝粒：着丝粒是DNA上的一段特殊结构，在细胞分裂时提供纺锤丝结合位点。有点着丝粒和区域着丝粒 端粒是真核生物（和某些原核生物）线性染色体两端的特殊DNA与蛋白质的复合体结构。 ARS:酵母的复制起点是指染色体上控制DNA复制起始的一小段 DNA 序列，通常称为 自主复制序列（ARS）。分为A、B、C三个结构域，A、B 2个结构域最重要。结构域A由11个核苷酸组成了保守序列，称为ARS共有序列（ ARS consensus sequence），简称ACS。 ORC：6种蛋白以复合体形式存在,称为起始识别复合物，简称ORC (origin recognition complex)。ORC与ARS共有序列ACS结合。 ORC特性类似原核生物DNA复制起始蛋白。 第4节 复制子与细胞周期 细胞周期与复制的2个普通的准则：