生物化学复习指南详细版【参考】.doc

1章 生物化学基础 一、一句话问题 生命形式虽然千差万别，在就化学本质而言，他们具有一致性。 生命体区别于非生命体的四个基本特征。 ①化学成分的同一性②严整有序的结构③新陈代谢④自我复制的能力（P1） 有机体遵行热力学第一定律，通过增大环境的无序而使得自身有序化。 生命体的信息流基本类同。 根据SSU RNA序列细胞分为三类，细菌、古细菌和真核细胞。古细菌与真核细胞更接近。 线粒体和叶绿体是通过内共生进入真核细胞。线粒体来源于紫细菌，叶绿体来源于蓝细菌。 细胞与细胞器--超分子复合体---- 大分子--单体 生物分子结构决定反应性、结构决定功能、结构也代表一种信息。 细胞内是一个水环境，水为细胞内生化反应提供了反应介质，甚至直接参与反应。 第2章 氨基酸与肽 概念 蛋白氨基酸：参与蛋白质组成的氨基酸（P17） 非蛋白氨基酸：不参与蛋白质组成的氨基酸(P17) 兼性离子（偶极离子）：氨基酸等电点（pH=pI）时，羧基以-COO-，氨基以-NH3+形式存在。这样的氨基酸分子含有一个正电荷和一个负电荷，称为兼性离子(P20) pI（等电点）：溶液中氨基酸处于净电荷为零时的pH成为等电点(P22) Paralogues:并（旁）系同源：一个个体中既有一定关系却又不相同的蛋白质（If two proteins within a family (that is, two homologs) are present in the same species, they are referred to as paralogs（并系同源）） Orthologues：直系同源：不同种属中具有相同功能的蛋白质（Homologs from different species are called orthologs（直系同源）） PITC：苯异硫氰酸酯（烃化剂，氨基酸反应，P23；肽段氨基酸序列测定，降解试剂，P50） DNP：二硝基苯酚（P48） 简答 写出20中氨基酸的三字母和单字母缩写，哪些属于酸性，哪些属于碱性，哪些含羟基，哪些含硫元素。 酸性氨基酸（及其酰胺）： ①天冬氨酸（Asp D）②谷氨酸（Glu E）③天冬酰胺（Asn N）④谷氨酰胺（Gln Q） 碱性氨基酸： ①赖氨酸（Lys K）②精氨酸（Arg R） 含羟基或硫氨基酸： ①丝氨酸（Ser S）②苏氨酸（Thr T）③半胱氨酸（Cys C）④甲硫氨酸（Met M） 中性氨基酸： ①丙氨酸（Ala A）②甘氨酸（Gly G）③缬氨酸（Val V）④亮氨酸（Leu L） ⑤异亮氨酸（Ile I） 芳香族氨基酸： ①苯丙氨酸（Phe F）②酪氨酸（Tyr Y）③色氨酸（Trp W） 杂环氨基酸： ①组氨酸（His H）②脯氨酸（Pro P） 什么是sanger反应，什么是Edman反应，它们在蛋白质测序过程中有何用途？ Sanger反应：二硝基氟苯（FDNB）法。多肽的游离末端氨基与FDNB反应生成二硝基苯多肽（DNP-多肽）（α-氨基酸很容易与FDNB作用，生成稳定的黄色DNP-多肽 可用于鉴定多肽链的N-末端残基（P48） Edman反应：（Edman化学降解法）降解试剂苯异硫氰酸酯（PITC）与肽键反应只标记和除去N-末端残基，肽链的其余肽键不被水解。N-末端残基被除去并鉴定后，剩下的肽链暴漏出一个新的N-末端残基，可与PITC发生第二轮反应。（P50） 可用于肽段氨基酸序列的测定 如何测定蛋白质的序列？ 亚基还原解离，N末端确定，氨基酸组成确定， 两组以上酶解，Edman降解确定每一个小片段的序列，序列拼接，对角线电泳确定二硫键位置。（P48-P51） 第3章 蛋白质的空间结构 概念 肽键：一个氨基酸的α-羧基与另一个氨基酸的α-氨基脱水缩合而成的 肽平面：肽键的实际结构是一个共振杂化体，C—N键具有双键性质，所以肽键是一个平面，称为肽平面（P44） ψ角：绕Cα—C键轴旋转的二面角（N—Cα—C—N）称为ψ φ角：绕N—Cα键轴旋转的二面角（C—N—Cα—C）称为φ（P58） 超二级结构：蛋白质中若干相邻的二级结构元件组合在一起，彼此相互作用，形成种类不多、有规则、稳定的二级结构组合或结构串，称为超二级结构（或折叠花式、折叠单位）（P63） 结构域：含数百个氨基酸残基的多肽链经常折叠成两个或多个稳定的、相对独立的球状实体，称为（结构）域（P64） 简答 如何确定蛋白质的空间结构 ①X射线衍射②核磁共振（NMR）③圆二色性（CD