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外 文 翻 译 题 目: 中国长吻鮠线粒体和微卫星位点的遗传变异 中国长吻鮠线粒体和微卫星微点的遗传变异 摘要:长江流域的中国长吻鮠的基因变异和种群结构通过线粒体控制区序列和核酸微卫星标记检测。线粒体控制区的的一个705bp片段的排序是根据132个样本来确定的,共确定了61个单倍体。长江流域的中国长吻鮠具有高的单倍体变异(h=0.9770±0.0041)的特点,但是核苷酸的变异水平较低(p=0.0081±0.0043)。Median-joining网络分析发现星形模式,岐点分布分析发现一个平滑的单峰分布,这表明长江流域的该种群经历了种群数量的膨胀接着是瓶颈效应或者它们起源于一个小型的建立者种群。据估计,种群数量膨胀的时间是在距今139000-435000年前,在更新世中期。分子方差分析和系统发育重建并没有检测到两个河段的显著地理差异。基因变异的模式进一步用核酸微卫星标记证明。在葛洲坝和三峡大坝上下游之间的基因变异差异在线粒体和核酸水平是非常小的,这表明近期这些大坝的建造导致中国长吻鮠遗传碎片。但是水坝对遗传结构潜在的恶化在未来是不容忽视的。 关键词:中国长吻鮠;线粒体控制区;微卫星;基因变异;种群结构 在河流系统中建造水坝是影响淡水环境最显著的认为因素之一。大坝尤其 影响鱼类的运动,而鱼类的运动决定着基因流和群体间的分化。葛洲坝是1971年建立在长江干流的第一个水坝。1994年开始建立的三峡大坝是世界上最大的水电站大坝,建立在距离葛洲坝上游38公里处,这两个大坝构成的屏障人为已经将长江流域分划为两个具有差异的地理面貌和鱼类区系。因此,人类有道德分裂可能会造成潜在的遗传结构分化并减少淡水生物多样性的遗传多样性。 中国长吻鮠一种半洄游的鱼类并且具有一定的商业价值。这种鱼类之前分布在辽河,黄河,淮河,长江,珠江和绵河,由于过度捕捞,环境污染,人类和其他因素的干扰,这一物种数量迅速下降。在过去的几十年里很多河流中这一物种已经消失,中国长吻鮠的主要栖息地长江干流和湖泊很少能发现这一鱼类了。长吻鮠是从20世纪80年代开始进行驯化和人工繁殖的。自从开始这一物种的人工饲养后,长吻鮠已经在沿江的各个省份发展起来,其在中国的商业意义也变得越来越重要。尽管一系列的研究已经在种群生物学,人工饲养,生物学行为和系统发育学等方面展开,但是目前在分子群体遗传方面的可用信息仍是较少。 野生动物的种群基因研究往往采用中性标记,比如,线粒体DNA和微卫星来估测个体和群体现存的变异数量。线粒体DNA作为标记物有很多适合用于群体遗传分析的属性,像较快的序列差异率,简单序列组织和母系遗传等等。他们提供了关于种群结构,地理变异,动物地理和亲缘关系的重要视角,尤其是线粒体DNA控制区可以显示出脊椎动物和无脊椎动物大多数的可变区,并且已经成为种群间和基因变异的特征地理模式的理想标记物。鱼线粒体DNA相比,微卫星是1至6个碱基的串联重复序列一类DNA位点ARLEQUIN3.0版本程序中实施分子方差分析 (AMOVA)被用来评估种群细分的地理格局。在 AMOVA中,单倍体型频率的相关性则在不同层次上作为模拟的F统计数据。Fst是估计种群内的遗传变异同整个样本的遗传变异的比例,而Fct则是估计种群间的遗传变异同整个样本的遗传变异的比例。这些F模拟统计的重要意义在于通过种群间的随即序列排序评估种群的遗传变异水平。 用两种不同的方法检测每个种群的种群数量历史。首先,当一个种群经历一个近期的扩张,中立的假设就会被推翻。因此,两个中立的测试被应用到目前的mtDNA控制区的序列:田岛的D实验,福的Fs实验。显著的负值可能是由种群扩增引起的。相反的是,种群数量的下降会导致田岛的D值积极的增长。这些实验和显著水平是在1000次模拟重新取样的基础上运用Arlequin3.0计算出来的。第二,使用Arlequin3.0分析整个群体的不匹配分布和各自分组来检测种群数量变化的历史。这种分析能够辨别一个种群是否经历了快速扩张或是随着时间的推移能够一直保持稳定。人口膨胀产生阿尔泰单峰分布(泊松相似曲线)和稳定的人口通常会产生一个多式联运分布作用已经被证明。可能出现的人口扩张时间(T,在几代人的数量),通过计算关系S =2u,其中s是不匹配的模式分布u是序列的突变率 U =2lk(L是每核苷酸突变率k是分析核苷酸的数量)。最后由中国长吻鮠的生成时间乘以T(4-5年)可以计算年扩张的大致时间。由于鱼化石稀少,只有很少提到与鱼类之间的分歧时间在DNA序列的突变产鱨类控制区每百万有1-2.5%的替代率这种突变率应用在目前的研究。 29.89%,23.37%14.13%32.61%EU790897-790

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