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第5章 基因组序列注释 学习重点： 1) 基因注释的方法 2) 基因功能的研究方法 2）外显子－内含子边界 外显子和内含子的边界有一些明显的特征如： 内含子的5‘端或称供体位（donor site）常见的顺序为 5’-AG↓GTTAAGT-3’； 3’端又称受体位（acceptor site), 多为5‘PyPyPyPyPyPyCAG-3’(“Py”嘧啶核苷酸，T或C)； 5.1.2 同源基因查询 同源查询 同源性,一致性和相似性 1） 同源性(homology)基因系指起源于同一祖先但序列已经发生变异的基因成员。 分布在不同物种间的同源基因又称直向同源基因。 同一物种的同源基因则称共生同源基因（水平基因）, 水平基因由重复后趋异产生。 基因同源性只有“是”和“非”的区别, 无所谓百分比. 相似性与一致性 249 MFN-MAI PFGAGAYAQALNQQQAALMASVAQGG 232 I LTSL TLPFS AGAYAQALNQQQTTV I S - -T S GS 注: 红色为一致性氨基酸, 蓝色为可取代氨基酸, 白色为趋 异氨基酸. 一致性氨基酸百分比为红色氨基酸所占的 比例, 相似性氨基酸百分比为红色和蓝色氨基酸相加 所占的比例