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18第十七章蛋白质的生物合成.
第十七章 蛋白质的生物合成
生物体内的蛋白质以mRNA为模板而合成。在这一过程中,mRNA上来自DNA基因编码的核苷酸序列信息转换为蛋白质中的氨基酸序列,故称为翻译(translation)。翻译是指在多种因子辅助下,由tRNA携带并转运相应氨基酸,识别mRNA上的三联体密码子,在核糖体上合成具有特定序列多肽链的过程。
第一节 蛋白质生物合成体系
蛋白质生物合成是细胞最为复杂的活动之一。参与细胞内蛋白质生物合成的物质.除原料氨基酸外,还需要mRNA作为模板、tRNA作为特异的氨基酸“搬运工具”、核糖体作为蛋白质合成的装配场所、有关的酶与蛋白质因子参与反应,ATP或GTP提供能量。
一、mRNA是蛋白质合成的信息模板
mRNA的发现回答了细胞核内基因组的遗传信息如何为蛋白质编码这一重要问题。从DNA分子中转录合成而来的mRNA分子在细胞质内作为蛋白质合成的模板,mRNA分子的编码区(开放阅读框)中的核苷酸序列作为遗传密码(genetic codes),在蛋白质合成过程中被翻译成蛋白质中的氨基酸序列。
生物对mRNA分子中核苷酸序列的翻译方式以3个相邻核苷酸为单位进行。在mRNA的开放阅读框架区,以每3个相邻的核苷酸为一组,编码一种氨基酸。如AUG被识别为甲硫氨酸和肽链合成起始信号、UCU允许丝氨酸进人新生肽链、UGA将被识别为终止信号。这样串连排列的3个核苷酸被称为一个三联体密码子(codon)。4种构成mRNA的核苷酸经排列组合可构成64个密码子(表17-1),其中61个编码20种直接在蛋白质合成中使用的氨基酸;另有3个不编码任何氨基酸,而作为肽链合成的终止密码子(terminator codon)。
遗传密码具有以下几个重要特点:
1.方向性 组成密码子的各碱基在mRNA序列中的排列具有方向性。翻译时的阅读方向只能从5至3,即从mRNA的起始密码子AUG开始,按5-3的方向逐一阅读,直至终止密码子。mRNA阅读框架中从5一端到3’一端排列的核苷酸顺序决定了肽链中从N一端到C一端的氨基酸排列顺序(图17-1a)。
2.连续性 mRNA的密码子之间没有间隔核苷酸。从起始密码子开始,密码子被连续阅读,直至终止密码子出现。由于密码子的连续性,在开放阅读框中发生插人或缺失1个或2个碱基的基因突变,都会引起mRNA阅读框架发生移动,称为移码(frame shift),使后续的氨基酸序列大部分被改变(图17-l b),其编码的蛋白质彻底丧失功能,称之为移码突变(frameshift muta-tion);如同时连续插人或缺失3个碱基,则只会在蛋白产物中增加1个或缺失1个氨基酸,但不会导致阅读框移位,对蛋白质的功能影响相对较小。
3.简并性 64个密码子中有61个编码氨基酸,而氨基酸只有20种,因此有的氨基酸可由多个密码子编码,这种现象被称为简并性(degeneracy)。例如,UUU和UUC都是苯丙氨酸的密码子,UCU、UCC、UCA、UCG,AGU和AGC都是丝氨酸的密码子。密码子AUG具有特殊性,不仅代表甲硫氨酸,如果位于mRNA起始部位,它还代表肽链合成的起始密码子(initiator codon)。
为同一种氨基酸编码的各密码子称为简并性密码子,也称同义密码子。多数情况下,同义
336 第三篇 遗传信息的传递
密码子的前两位碱基相同,仅第三位碱基有差异,即密码子的特异性主要由前两位核苷酸决定,如苏氨酸的密码子是ACU,ACC,ACA,ACG。这意味着第三位碱基的改变往往不改变其密码子编码的氨基酸,合成的蛋白质具有相同的一级结构。因此,遗传密码的简并性可降低基因突变的生物学效应。
4.摆动性 密码子的翻译通过与tRNA的反密码子配对反应而实现。这种配对有时并不严格遵循Watson-Crick碱基配对原则,出现摆动(wobble)。此时mRNA密码子的第1位
第十七章 蛋白质的生物合成 337
位碱基(5’-3’)与tRNA反密码子的第3位和第2位碱基(5’叶3’)之间仍为Watson-Crick配对,而反密码子的第1位碱基与密码子的第3位碱基配对存在碱基配对摆动现象。
如某种tRNA上的反密码子第1位为次黄嘌呤核苷(inosine,I),则可分别与mRNA分子中的密码子第3位的A,C或U配对;反密码子第1位的U可分别与密码子第3位的A或G配对;反密码子第1位的G可分别与密码子第3位的C或U配对(图17-2)。由此可见,摆动配对能使一种tRNA识别mRNA序列中的多种简并性密码子。
5.通用性 从细菌到人类都使用着同一套遗传密码,这一方面为地球上的生物来自同一起源的进化论提供了有力依据,另外使我们有可能利用细菌等生物来制造人类蛋白质。遗传密码的通用性中仍有个别例外,在哺乳类动物线粒体内有些密码子编码方式不
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