张德安,张今:试论空间编码 “通过t-链段R1与其密码子相对应,R2与核酸碱基的特异相互作用,以及一些沿革的立体化学限制,保证蛋白质以其立体特异位点,精确地识别出核酸的特定位点,与之密切地相互作用。” 同DNA复合的立体特异位点中二级结构模式图 a.两个反平行肽链段以氢键结合,形成gt(a)和gg(b)双股多肽螺旋。 空间编码性质: 简并性 通用性 RNA空间编码 郑晓飞.RNA空间编码探析,2014,34(4):479-483 RNA空间编码:RNA与其他分子特异相互作用中,RNA的控制位点与其相应的作用分子立体特异位点之间的直接结构互补性。 RNA空间结构同线性结构一样包含着重要生物信息。RNA空间编码蕴含了RNA功能信息。 RNA空间编码 RNA空间编码存在的基础 1.RNA中有近百种修饰核苷酸 包括:修饰碱基、修饰核糖、碱基与核糖连接方式异构 (修饰核苷通过改变碱基配对位置、除去氢离子来源、通过修饰基团的 位阻作用、推电作用或吸电作用、改变结构柔性和形成新的氢键等多 种方式影响RNA的高级结构) 2.RNA以单链形式存在,碱基配对方式丰富、复杂。RNA碱基的配对方 式有12类100多种形式。 包括:顺、反式Watson-Crick/Watson-Crick碱基对 顺、反式Watson-Crick/Hoogs
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