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[分子力场
(a) 间接药物设计 这类方法从一组小分子（例如几十个）化合物的结构和生物活性数据出发 ———分子力学和动力学模拟———研究其结构－活性关系的规律———在此基础上预测新化合物的生物活性（药效）和进行高活性分子的结构设计。 Evaluation only. Created with Aspose.Slides for .NET 3.5 Client Profile 5.2.0.0. Copyright 2004-2011 Aspose Pty Ltd. 定量构效关系（QSAR）是一种重要的间接药物设计方法。 小分子化合物(理化参数和生物活性数据) 线性回归／拟合各项系数 构－效关系方程 预测生物活性 设计具有更高活性的药物分子。 Evaluation only. Created with Aspose.Slides for .NET 3.5 Client Profile 5.2.0.0. Copyright 2004-2011 Aspose Pty Ltd. 药效基团模型方法是一种重要的间接药物设计方法。 药效基团通常是指那些可以与受体结合位点形成氢键相互作用的、静电相互作用、范德华相互作用和疏水相互作用的原子活性官能团。 分析和比较化合物化学结构 找共同特征结构 建立药效基团模型。 Evaluation only. Created with Aspose.Slides for .NET 3.5 Client Profile 5.2.0.0. Copyright 2004-2011 Aspose Pty Ltd. (b) ? 直接药物设计 这类方法以药物作用的对象“靶标”生物大分子的三维结构为基础———进行分子力学计算———研究小分子与受体的相互作用———设计出从空间形状和化学性质方面都能很好的与靶标分子相结合的药物分子。 随着分子生物学、细胞生物学和分子动力学的发展，越来越多的药物作用靶标分子（蛋白质、核酸、酶等）被分离出来，其结构被阐明，为直接药物设计方法的应用提供了有利条件。 Evaluation only. Created with Aspose.Slides for .NET 3.5 Client Profile 5.2.0.0. Copyright 2004-2011 Aspose Pty Ltd. * * ? 分子模拟概论 计算机模拟在高分子和生物大分子领域的应用从20世纪60年代至今已经发展到一个崭新的阶段。它是基于3个方面的发展： 1.分子力场的发展 2.模拟分子体系算法的发展 3.计算机硬件软件的发展 Evaluation only. Created with Aspose.Slides for .NET 3.5 Client Profile 5.2.0.0. Copyright 2004-2011 Aspose Pty Ltd. 1. 分子模拟法是用计算机以原子水平 的分子模型来模拟分子的结构与行 为，进而模拟分子体系的各种物理 与化学性质。 Evaluation only. Created with Aspose.Slides for .NET 3.5 Client Profile 5.2.0.0. Copyright 2004-2011 Aspose Pty Ltd. 分子模拟不但可以模拟分子的静态结构，也可以模拟分子的动态行为（分子链的构象、分子的吸附、分子的扩散以及相互作用）。 Evaluation only. Created with Aspose.Slides for .NET 3.5 Client Profile 5.2.0.0. Copyright 2004-2011 Aspose Pty Ltd. 分子模拟包括四种方法： 量子力学法 蒙特卡洛法 分子力学法 分子动力学方法 Evaluation only. Created with Aspose.Slides for .NET 3.5 Client Profile 5.2.0.0. Copyright 2004-2011 Aspose Pty Ltd. 2. 由于没有近似（除力场的函数与参数是 从实验中得到的之外）而遵从严格的物 理定律，分子模拟法也称作——“计算机 实验”方法。 Evaluation only. Created with Aspose.Slides for .NET 3.5 Client
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