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(用查文献方法
??? 先给大家一段查询语言:(myocardial[Title/Abstract] AND infarction[Title/Abstract]) AND (loattrfull text[sb] AND 2008/09/26[PDat] : 2009/09/25[PDat] AND English[lang] AND Review[ptyp])。能看懂吗,是不太复杂了?其实就是查询近一年的关于心肌梗死的英文综述。所幸的是,我们不需要记这样的查询语言,有了PubMed,我们完全可以简单的操作就可查到想要的目标文献。呵呵,有点像做广告哈。
先介绍一下pubmed
PubMed包括MEDLINE和PREMEDLINE的完整内容。它还包括一些被MEDLINE认为超出范围的文章和杂志,(这些文章或杂志)由于内容或在某一时期不在索引范围内。因此PubMed是比MEDLINE的更大的集合。看一下它所收录的数据库:
PubMed现已有19 million文章信息(文章的名称,发布日期杂志,摘要,全文链接以及与要查询内容相关的文章),最早的文章可追塑到1948年。另外,PubMed Central还能提供大概300000篇免费全文。因此,PubMed是科研过程中文献查找的一个最重要的工具,就我个人而言,一般是先在PubMed中找到全文链接,然后再上相应的数据库查找。下面我们就一步步的教大家如何有效应用该资源。
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首先,进入PubMed的首页面,网址是/pubmed/, 如果从NCBI首页进入,Search的地方选择PubMed就可进入了。
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页面介绍:
最上面一行为查询框,在首页的文字部分给出了三种查询方式:1、topic主题检索。很简单,在查询框输入主题词(如:心肌梗死myocardial infarction),点右边的“go”就OK了;2、authors著者检索。注意:这里人名用的是中国人的习惯,即姓+名字的首字母。如中国作者张海洋为Zhang HY,外国作者Fishman EK,都是姓在前,名在后。3、journals期刊检索。可以用期刊的全称或缩写。
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从最简单的开始,比如说我们想要查询一篇心肌梗死的文章,在查询框中输入myocardial infarction,出现以下页面,
注意,在查询由两个以上的单词组成的主题词的时候,我们可以将其加上括号或者双引号,如(myocardial infarction),“myocardial infarction”,这样PubMed在查找的时候会将其做为一个整体来查询,而不会将两者分开分别进行查询。
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从上图中我们可以看到,默认情况下,文章信息包括题目,作者,杂志及其发表年月卷期页,PMID号,以及相关文章等列出来,每页20篇文献,以发表日期为排序依据。文章的显示信息的方式是可以更改的,
其中,Display 可选择Summary, Brief(简要信息,包括杂志和PMID), Abstract(仅摘要)o等其他方式。 Show表示每页显示的文章数,可选择20、50、100篇等。Sort By指的是文章的排序,可按作者,发表日期,杂志名等排序。Send to指的是将该页面发送到想要存放的地方,其选择有Text(文本格式),File(文本文件即txt文件,该格式是很多文献引用软件导入文献时所用的格式,如Endnote等),E-mail等;但需注意的是,保存或发送的仅仅是该页面的文章,也就是默认情况下的20篇,如果想将较多的文献一起保存的话,可以在Show中选择每页展示多一些的文章数后再保存。
?表示本次查询到共158208篇文章,其中综述19646篇,我们点击它后便只显示综述类文章了。在综述文章后面还有一个小工具的图标,它允许用户在PubMed上注册用户,然后可将这些搜索结果保留下来,还可以将该查询相关的新的文章发到个人E-mail中,是一项很有用的工具。
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在检索结果页面的右侧还有该次检索结果中PubMed中心拥有的免费文章,可以免费得到全文下载。
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上面介绍的是最基本的查询,但我们发现,这样查找出来的文章如以心肌梗死myocardial infarction为主题词查找共查出来158208篇,如此大数量的文章是没法阅读的,也没有重点,因此我们需要将查询细化,这时我们便用到了下图圈出的工具了。
Limit可以限制检索的主题词在印刷物题目,摘要还是全文,可限制文献的语言是英文,中文或者其他,可限制文献性质是研究文章还是综述,还可限制文章的发表日期。值的注意的是,使用“Limit”会排除还未标引好的文献。如果你要查找最新文献,建议不要使用Limit。下面给一个具体的例子,比如说我们要查找一篇最近1年发表的题目或摘要中有心肌梗塞主题词的英文综述文章,要求找到的文献有全文
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