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台大物理系显微生物物理实验室之.
台大物理系顯微生物物理實驗室之
現況與展望
駱 文、董成淵
台灣大學物理系
E-mail: b7202009@ms.cc.ntu.edu.tw
台大顯微生物物理實驗室於去年成立,由董成淵助理教授主持。經過一年多胼手胝足的努力,目前有初步規模,本文將介紹目前實驗室的工作近況,與未來發展的方向,並與各位分享創立這跨領域實驗室的歷程。
引言
隨著近年來生物科技的蓬勃發展,生命科學儼然已成為各國科學界的研究重心,然而對於國內物理界而言,生物物理還算是一個嶄新領域。
近年來,生物物理已漸漸受到國內外物理學界的關注,諾貝爾物理學獎得主朱棣文,也已將生物分子物理性質研究列為其主要研究方向之一。生物巨分子的尺寸大至公分以上,小至奈米尺度,加上生物分子有再製容易、快速的特性,生物科技有製造成為奈米機械的潛力。台大物理系極早便已注意到生物物理的潛力與重要性,除了持續開設生物物理的基礎課程外,更於去年延聘以螢光顯微見長的董成淵博士為助理教授,成立了顯微生物物理實驗室,希望能積極推動生物物理實驗、研究以及基礎的教學課程。
物理人才在生物領域的重要性
一般物理界學者可能認為物理學與生命科學是屬於截然不同的領域。但物理實驗方法的研發往往導致醫學技術重要的發展及生物學突破性的研究。首位諾貝爾物理獎得主侖琴,因為發現了X光而得獎,而今日X光在醫學及結構生物學等領域,都是不可或缺的重要工具。另外像是核磁共振儀(NMR)、放射線醫學、雷射等重要物理學家所研發出來之實驗方法,均有效的被應用於探索生物系統或是改進醫療方式。
一般而言,物理學家在工程與設計上的經驗較為豐富,若能與生物學家合作,極有機會對醫學應用及生物實驗系統作出突破性的改良。
除了技術上的發展,物理學家所有的堅強數理背景也在生物學的理論及模型建立方面,有極大的貢獻。近年來,生物學家所關注的蛋白質摺疊問題,就已經有不少物理學家投入理論及模擬模型的工作,也有了相當的進展,物理學家所擅長的計算方法,也對生物界在面對數目龐大且複雜的實驗數據提供了不少協助。
這樣說來,只要能先對基礎的生物生理學有些了解,許多具有物理、工程背景的學者隨時都有機會加入生物、醫學物理的領域。筆者想強調的是,基礎的生物學對於任何一位想要涉足生物物理領域的人都是必要的,生命科學一如生命本身,是一門龐大且繁複的科學,光是要了解生物學領域的專有名詞,就要費不少功夫,遑論深入研究生物系統了。筆者在頭幾回參加生物物理會議時,台上的講者提及的專業術語,對了解演講內容是相當大的障礙,直到筆者對生物有了相當的認識後,才漸漸踏入這個有趣又極為重要的領域。
在生物物理的領域有兩個主要的方向,一是科學帶領 (science-driven)上的研究,一是科技帶領(technology-driven)上的突破與創新,對生物物理有興趣的物理學家們必須對生物學有基本的認識方可了解到生命科學裡的重要課題,使我們在生物物理研究上更具前瞻性,更貼近種種生命現象的源頭,透過與物理學結合的生物研究,找出生物物質結構與其功能之間奧妙的關係。
而科技的創新也是不可或缺的。舉例來說,1990年Denk[1]等人架立了第一台雙光子顯微鏡,然而商業化的雙光子顯微鏡則是到了數年以後才出現,如果我們不自己在技術上求創新,直接購買商業化的產品,雖然在某些應用上相當便利,但也意味著這時我們所使用的技術已經相當成熟了。除了有效的應用已成熟的技術之外,國內也必須力求創新因而研發出的嶄新方法,這樣我們方可期望能擠身世界研究尖端。
主要研究方向
生物學所研究的範圍小至細胞中的單分子,大致整個生物圈,生物物理所包含的領域自然也是極為寬廣的。本實驗室目前以生物光學顯微技術為主,專注於以光學顯微鏡的技術,觀測及操控生物系統,至於所研究的生物系統,則是從生物分子到組織層次不等。
單一生物分子的物理現象
圖表1 圖一為三個單一Lambda DNA分子(48502 base pairs)加上螢光劑,透過CCD 像機取下的DNA的影像。
傳統上,科學家們僅能透過測量化學反應前後,生物分子群(ensemble)的變化測量生物分子特性之平均值。然而ensemble的研究並無法讓我們了解單一生物分子詳細的運作機制。近年來各種儀器與技術有了突破性的發展,使得我們有能力利用原子力顯微鏡(AFM)[2]、光鑷子(optical tweezers)[3]、磁鑷子(magnetic tweezers)[4]等設備,真正的操控單一生物分子,並且直接量測這些分子的物理特性。
目前我們正致力於結合顯微操控技術、全反射顯微術、FRET(Fluorescence Resonance - Energy-Transfer)操控並偵測單一生物分子。FRET 是一種螢光光譜技術,可用來量測分子間的距離。FRET是利用dono
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