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Chapter 1 Protein 化学（2） 蛋白质结构的不同组织层次 二级结构 多肽主链中各个肽段借助于相邻氨基酸（amino acid，aa）之间的氢键形成的构象。 主要有α-螺旋、β折叠、β-转角、无规卷曲。 超二级结构 由两个以上二级结构单元相互聚集形成的有规则的二级结构的组合体。 例如αα、βαβ、βββ。 结构域 大的球蛋白，多肽链形成几个紧密的球状构象，彼此以松散的肽链相连，此球状构象是结构域。 结构域是多肽链的独立折叠单位，一般由100-200个氨基酸残基构成。 三级结构 整条多肽链或亚基通过盘旋、折叠，形成紧密的、借各种次级键维持的球状构象。 二、肽平面 肽平面 肽：一个aa的羧基和另一个aa的氨基脱水缩合而成的化合物。其中的氨基酸单位称氨基酸残基。 肽键：aa间脱水后形成的共价键称肽键（酰氨键）。比典型的C-N单键短，比典型的C＝N双键长，具有40%双键特性。 肽单位：酰胺平面，肽单位间 以α-C原子相隔，构成肽链。 肽键的结构特点 酰胺N的孤对电子与相邻羰基 之间形成共振杂化体。 肽键具有部分双键性质， 不能自由旋转。 肽键具有平面性，组成肽键的4个原子和2个Cα几乎处在同一平面内（酰胺平面）。 肽键亚氨基在pH 0-14内不解离。 肽链中的肽键一般是反式构型， Pro的肽键可能出现顺、反两种构型。 一级结构：N-Glu-Gly-Ala-Lys-C 肽链的二面角 Trans or Cis P 27-28 肽平面中两个Cα处于肽键的两侧，即处于对角，两个Cα距离最远时，为反式（trans）构型； 两个Cα处于肽键的同一侧，它们靠的最近，为顺式（cis）构型。 一级结构（共价结构） 胰岛素的一级结构 A、B两条链组成； 1个链内二硫键； 2个链间二硫键； A链顺序（21aa）： Gly-Ile-Val-Glu------ B链顺序（30aa）： Phe-Val-Asn-Gln------ 提 问：影响蛋白质构象的作用力有哪些？ 内力（内因）：蛋白质分子内各原子间作用力 外力（外因）：与溶剂及其他溶质作用力 原理—“内因为主，外因通过改变内因起作用” 按不同种类内力以及产生的构象变化把构象划分为二、三、四级层次。 蛋白质的高级结构研究方法 三、二级结构 1、α-螺旋 (α-helix) （1）α-螺旋 的结构特点 2、β-折叠 (β—sheet structure) 3、β-转角（β-turn ） 4、无规卷曲(random coil) 5、胶原蛋白——另一种螺旋结构 四、超二级结构 （1）αα cytochrome c myohemeyrthrin ferritin （2）βXβ单元 （3）ββ（β迂回） 五、结构域 结构域自身是紧密装配的，但结构域之间关系相对松懈。 结构域之间通过铰链（合叶）相连，通过铰链的松紧（合叶的开合）使其相对运动。 大的蛋白质或亚基，由多个在空间上明显区分的、相对独立的区域性结构（结构域）缔合而成三级结构（Eg. 腺苷酸激酶，2个结构域）； 较小蛋白质或亚基来说，结构域和其三级结构是一个意思，即单结构域（Eg. 磷酸丙糖异构酶）。 锌指结构（zinc fingre） 锌指：一种常出现在DNA结合蛋白中的一种结构基元。是由一个含有大约30个氨基酸的环和一个与环上的4个Cys或2个Cys和2个His配位的Zn2+构成，形成的结构像手指状。 指的是在很多蛋白中存在的一类具有指状结构的结构域，大多都是与基因表达的调控有关的功能蛋白。 共同特征是通过肽链中氨基酸残基的特征基团与Zn2+的结合来稳定一种很短的，可自我折叠成“手指”形状的的多肽空间构型。 六、三级结构 七、四级结构 血红蛋白结构 镰刀形细胞贫血病 八、蛋白质变性与复性 分子伴侣 是一种可以增加蛋白质正确折叠速率的蛋白质； 通过与没有完全折叠好的新合成的多肽链结合发挥协助折叠作用； 防止不正确折叠中间产物的形成； 与未组装的蛋白质亚基结合，防止在正确组装前聚沉。 疯牛病 朊病毒，朊蛋白； 28 KD小蛋白质； 神经组织的细胞膜上的糖蛋白 正常构象→非正常构象 2、稳定三级结构的次级键 疏水键 氢键 盐键 范德华力 二硫键（共价键） 疏水键——蛋白质三级结构中起着重要作用 Evaluation only. Created with Aspose.Slides for .NET 3.5 Client Profile 5.2.0.0. Copyright 2004-2011 Aspose Pty Ltd. 疏水键 -“非极性基团被极性水分子排挤相互聚拢”作用力。 离子键（或盐键） 氢键-侧链间形成 范德华力（分子间作用力，受彼此距离影响） Evaluation