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实验二凝胶图像分析.
实验二:凝胶图像分析
姓名:李婉贞 班级:09药学1班
【实验目的】
本实验的目的是学会使用Gel-Pro Analyzer,进行DNA的定量、定性分析。
【实验过程】
DNA分析
(1)首先打开Gel-Pro程序,选择“DNA analysis”,点击“OK”
打开一张tif格式保存的图片,选择DNA,打开,避免错选图片,可进行预览
(2)若条带横向不是很水平,竖向不是很垂直,可以用“1D-Gel”工具栏上的“Rotate”进行旋转
点击“Lanes”进行泳道的选择
选好泳道后,进行“Band”选择,点击任意一条泳道,在光密度示图上就会出现该泳道上各个条带的光密度,如下图
(3)点击“M.W Standard”,进行内标的设置,点击“Reset”,选择分子量标记Marker的泳道。选择泳道后,对该泳道上的各个条带进行分子量标记。点击“New”,在“Name”输入“DL2000”,点击“Add”,依次输入“2000、1000、750、500、200、100”。
结果如下,点击“Auto Locate”,各个分子量自动标记到Lanel的对应条带上
(4)对各个泳道上的目的条带进行分子量的确定,点击“Results”,结果如下,黑字表示泳道各个条带的分子量,Gel-Pro定义每条泳道的总DNA含量是100ng,每个条带则依据亮度(光密度值)比例确认各个条带的ng数,也就是下图的蓝字所示:
【实验结果】
结果,以光密度值IOD表示
二、蛋白质电泳图分析
与DNA电泳图的分析差别没有太大的不同,只是实验类型选择“Protein analysis”。
三、杂交带分析
(1)实验类型选择“Dot blot analysis”,打开杂交图像
(2)点击“Dlots”,设定7×8的网格,在“Diameter”设置直径为45,将“Look Dots”选项设定为空,自行挪动生成的圆圈到杂交点上,点击“OK”,结果如下:
(3)点击“Mass/IOD”进行各个杂交点的整合光密度值分析,结果如下:
(4)菌落计数
(1)实验类型选择“Colony counting”,打开一个平底培养基的图像
(2)设定计数范围,点击“Select Area”,用鼠标在图像上选择一个圆形区域,如下图
(3)对菌落形态进行过滤选择,点击“Filter”,排除我们不需要的菌落类型,各种不符合规范的菌落种类已经给出,点击“Count”进行计算
可以看出,该平皿上的菌落都符合要求,共计10个
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