或译DNA定序)是指分析特定DNA片段的碱基序列..doc

DNA定序 DNA测序（DNA sequencing，或译DNA定序）是指分析特定DNA片段的碱基序列，也就是腺嘌呤（A）、胸腺嘧啶（T）、胞嘧啶（C）与鸟嘌呤的（G）排列方式。RNA测序则通常将RNA提取后，反转录为DNA后使用DNA测序的方法进行测序。目前应用最广泛的是由Frederick Sanger发明的Sanger双脱氧链终止法（Chain Termination Method）。新的测序方法，例如454生物科学的方法和焦磷酸测序法。 Sanger测序法 Sanger（桑格）双脱氧链终止法是Sanger于1975年发明的。测序过程需要先做一个PCR反应。PCR过程中，双脱氧核糖核酸可能随机的被加入到正在合成中的DNA片段里。由于双脱氧核糖核酸多脱了一个氧原子，一旦它被加入到DNA链上，这个DNA链就不能继续增加长度。最终的结果是获得所有可能获得的、不同长度的DNA片段。目前最普遍最先进的方法，是将双脱氧核糖核酸进行不同荧光标记。将PCR反应获得的总DNA通过毛细管电泳分离，跑到最末端的DNA就可以在激光的作用下发出荧光。由于ddATP, ddGTP, ddCTP, ddTTP（4种双脱氧核糖核酸）荧光标记不同，计算机可以自动根据颜色判断该位置上碱基究竟是A，T，G，C中的哪一个。 454生物科学和焦磷酸测序法 454测序法由454生物科学发明，是一个类似焦磷酸测序法的新方法。2003年向GenBank提交了一个腺病毒全序列，使得他们的技术成为Sanger测序法后第一个被用来测生物基因组全序列的新方法。454使用类似于焦磷酸测序的方法，有着相当高的读取速度，大约为5小时可以测两千万碱基对。 已测序的生物指其基因组已经被完全测序的生物。其中部分生物的DNA序列已经被完全注释，功能性的片段（如基因等）已作图。借助於基因组研究及高通量处理等技术，越来越多的生物的全部基因被人们获得。自从1995年以来已经有150个基因组被解密，将近每个星期有新的物种添加进来。 已测序的生物列表 下表是目前爲止已经被相当完全测序的生物。 古菌 Aeropyrum perni - Archaea aus japanischen Thermalquellen Archaeoglobus fulgidu - Schwefel-Archaea Halobacterium spec - Archaea aus Salzseen Methanobacterium thermoautotrophicu - Methanproduzierender Archaea Methanococcoides burtoni - k?ltetolerante und aerobe Archaea aus dem Ace Lake, Antarktis Methanococcus jannaschi - Tiefseearchaea an Black Smokern Methanococcus maripalud - Archaea aus Salzseen in Georgia Methanogenium frigidu - k?ltetolerante und aerobe Archaea aus dem Ace Lake, Antarktis Methanopyrus kandler - Tiefseearchaea an Black Smokern Methanosarcina acetivoran - Archaea aus ?lquellen, Kuhm?gen u. a. Methanosarcina maze - Archaea mit der F?higkeit Acetat u. a. abzubauen [equitans - Archaea an hei?en Quellen, Parasit anderer Mikroorganismen Pyrobaculum aerophilu - Archaea aus hei?en Quellen Pyrococcus abyss - Tiefseearchaea an Black Smokern Pyrococcus furiosu - Tiefseearchaea an Black Smokern Pyrococcus horikoshi - Tiefseearchaea an Black Smokern Pyrolobus fumari - Tiefseearchaea an Black Smokern Sulfolobus solfataricu - Archaea aus hei?en Schwefelquellen Sulfolobus t