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生化知识总结.
蛋白质
蛋白质的元素组成:碳氢氧氮硫,有些含磷和其他金属元素如铁锰钴镍铜锌
蛋白质含量:细胞干重的百分之五十以上
凯氏定氮法的基础:蛋白质中氮含量接近16%。凯氏定氮法公式:蛋白质含量=含氮量×100/16
蛋白质分子量:几千到几十万
氨基酸
氨基酸碳原子编号:方法①:羧基碳原子编号为C-1,侧链碳原子依次编号为C-2,C-3...方法②:与羧基相连的碳原子标记为α-碳(中心碳原子),侧链基团的其他碳原子依次编号为β、γ、等
氨基酸分类:①R基团为非极性的氨基酸:
②R基团为极性不带电荷的氨基酸(较易溶于水)
特殊氨基酸:甘氨酸(不含手性碳),脯氨酸(唯一的亚氨基酸),半胱氨酸(巯基氧化形成二硫键,二硫键可以在一条肽链内形成折叠,也可以在两条肽链间形成连接)
③R基团带电荷的氨基酸
酸性氨基酸(生理条件下给出质子,自身带负电荷)
碱性氨基酸(生理条件下获得质子,自身带正电荷)
其他氨基酸分类方式:分为脂肪族氨基酸、芳香族氨基酸和杂环氨基酸;分为必需氨基酸和非必需氨基酸
蛋白质中的稀有氨基酸:
概念:遗传密码只对应20种氨基酸,但蛋白质中还有很多种其他氨基酸,是翻译后经过加工而来,称为蛋白质的稀有氨基酸。
两种重要的稀有氨基酸:4-羟基脯氨酸和5-羟基赖氨酸(是哺乳动物体内最丰富的蛋白质胶原蛋白的组成成分)
N-甲酰甲硫氨酸是所有原核生物肽链N端的第一个氨基酸。
蛋白质中稀有氨基酸的存在会影响蛋白质的溶解性、稳定性以及与其他蛋白质的相互作用,从而使蛋白质的功能更加丰富。
第二十一种氨基酸:硒代半胱氨酸。是丝氨酸的衍生物(硒代氧),是在蛋白质合成时进入肽链而非在肽链合成后修饰形成。它有自己的密码子和tRNA.某些古菌中还有第23种氨基酸。
非蛋白质氨基酸:非蛋白质氨基酸是常见氨基酸的衍生物,所以大多也是L-α-氨基酸(细菌蛋白、抗生素蛋白、放线菌素蛋白含有一些D-氨基酸),不参与蛋白合成但具有广泛的生理功能如毒蛋白、生化反应的前体或中间产物、植物抗逆性等。
氨基酸的酸碱性质:氨基酸分子含有氨基和羧基,在溶液中呈解离状态。氨基酸是两性电解质,同一种氨基酸在不同pH条件下可以带正电荷、负电荷或净电荷为零。若某种氨基酸在某pH溶液中所带静电荷为零,此时整个分子呈电中性。此时溶液的pH值称为氨基酸的等电点,用pI表示。
用K1代表羧基的解离情况,K2代表氨基的解离情况,KR代表R基的解离情况。酸性氨基酸:PI=1/2(PK1+PKR),碱性氨基酸:PI=1/2(PK2+PKR)。等电点的测定:在不同pH值溶液中对氨基酸进行电泳,样品在电场中不迁移时的电泳缓冲液的pH值为氨基酸的等电点。(蛋白质的等电聚焦电泳:在电泳时让凝胶中产生pH梯度,蛋白质样品在相当于该蛋白质等电点的pH值位点不再移动,凝集成一条带。组氨酸是生理条件下唯一具有明显的缓冲作用的氨基酸。
氨基酸的立体化学:除甘氨酸外,常见氨基酸的α-碳原子是一个不对称碳原子,即手性碳原子。
生物化学中立体异构的命名是根据绝对构型来命名的,不是由旋光性。L和D指的是四个基团的空间相对位置,与旋光值正负没有关系,旋光值正负是由旋光仪来测定的。
氨基酸的吸收光谱:酪氨酸Trp280nm,色氨酸Tyr275nm,苯丙氨酸Phe257nm。(主要是酪氨酸吸收,所以蛋白质的吸光值一般认为280nm)
氨基酸的重要化学反应:
茚三酮反应:弱酸性条件下,氨基酸脱氨脱羧,还原茚三酮,生成蓝紫色产物水合茚三酮。(脯氨酸的茚三酮反应呈黄色)
Sanger反应:在弱碱性条件下,氨基酸的α氨基与2,4二硝基氟苯反应生成二硝基苯氨基酸(肽链就生成2,4二硝基苯肽),然后用酸水解,所有氨基酸都被解离下来,只有α氨基端的氨基酸因为连有疏水基团所以溶于乙酸乙酯(黄色的),所以可以用乙酸乙酯进行抽提,并用标准液进行对照,确定氨基端具体是哪种氨基酸。
Edman降解反应:苯异硫氰酸酯和N末端氨基酸反应,使其脱去,暴露出新的N末端,所以可用于蛋白质N末端氨基酸的测定以及氨基酸序列的分析测定。
肽
一个氨基酸分子的α氨基与另一个氨基酸分子的α羧基脱去一分子水形成的酰胺键称为肽键。肽是氨基酸通过肽键连接形成 的线性聚合物(十个以下的叫做寡肽)
肽的命名:按照由N端到C端的氨基酸残基的排列顺序进行命名。也可以根据其生物功能进行命名。
天然活性多肽:谷胱甘肽,还原型谷胱甘肽是三肽,氧化时两个巯基脱氢成为二硫键,在体内作为氧化还原缓冲剂,起到抗氧化、抗自由基的作用,能够清除正常有氧代谢和生长中产生的对机体有毒性的氧化性物质。谷胱甘肽(GSH)可以维持
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