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植物RNA的快速提取.
RNA提取(TRIZOL法)
一、原理
TRIzol是一种快捷方便的总RNA提取试剂,可以从动物组织、各种微生物及细胞等中提取总RNA。在样品处理过程中,TRIzol可完全充分裂解样品,同时保持RNA的完整性。加入氯仿离心后,溶液形成上清层(水相)、中间层和有机相(下层)。取出上清层,可用异丙醇沉淀回收RNA;中间层用乙醇沉淀回收DNA;有机相可用异丙醇沉淀回收蛋白。TRIzol试剂可用于少量样品的RNA提取,也可用于大量样品的RNA提取。提取RNA 整个过程方便快速,整个操作过程可一个小时内完成,提取的RNA无蛋白和DNA的污染,纯度髙,可直接用于Northern Blotting、斑点杂交、polyA筛选、mRNA纯化、体外翻译、RNase保护分析、RT-PCR、构建cDNA文库等各种分子生物学实验。
二 操作步骤
RNA提取过程的关键是建立一个无RNase的实验环境,因此在整个操作过程中要防止RNase的污染,应注意以下几点:
1.实验过程中经常更换新手套,使用专用超净台,在操作过程中避免讲话; 2.应尽量使用无RNase的实验器材;枪头、塑料制品和玻璃制品可以用0.1%DEPC(焦碳酸二乙酯)水溶液在37℃处理过夜,然后 在120℃下高压灭菌30min以去除残留的DEPC。玻璃制品也可用干热灭菌去除RNase(180℃烘烤2h); 3.配制溶液应使用无RNase水(无RNase水的配制方法:双蒸水加入DEPC至终浓度0.01% V/V,放置过夜,然后120℃下高压灭 菌30min,备用); 4. 整个实验过程中使用的试剂,实验器材和无RNase水应专用,避免交叉污染。
用户自备试剂:氯仿、异丙醇、75%乙醇(用DEPC处理过的水配制)、无RNase的无菌水。样品处理
A 贴壁培养细胞
① 倒净培养液;
② 每10cm2生长的培养细胞中加入1mL硕盟TRIzol试剂,在室温下水平放置5min,使裂解液均匀分布于细胞表面,然后用移液枪 吹打细胞使细胞脱落;
③ 将细胞裂解液转移至离心管中,并用1mL枪头反复吹打直至裂解液中无明显沉淀,在室温下放置5min,使得核酸蛋白复合 物完全分离;
B 悬浮培养细胞
① 直接离心收集细胞,倒净培养液;
② 细胞沉淀中每5~10×106细胞加入1mL硕盟TRIzol试剂;
③ 将细胞裂解液转移至离心管中,并用1ml枪头反复吹打直至裂解液中无明显沉淀,在室温下放 置5min,使得核酸蛋白复合物完全分离;
C 动、植物组织材料
① 将组织在液氮中磨碎成粉末状(应无明显颗粒);
② 每50~100mg的组织加1mL硕盟TRIzol试剂,样品的体积不应超过TRIzol试剂体积的10%,并用匀浆器进行匀浆,直至匀浆液呈无颗粒透明状;
③ 将细胞裂解液转移至离心管中,在室温下放置5min,使得核酸蛋白复合物完全分离;
④ 12,000g, 4℃离心10min,然后小心吸取上清液,移入新的离心管中;
2. 向上述步骤1得到的裂解液中加入氯仿(每使用1mL硕盟TRIzol加0.2mL氯仿),盖紧离心管管盖,用手上下振荡15s(请勿涡漩激烈振荡),得粉红色浑浊液,无分层现象,室温静置3min;
3. 12,000g,4℃离心15min;
4. 取出离心管,样品分为三层:无色的上清水相、中间的白色层及粉红色的下层有机相。小心吸取无色上清水相移至另一离心管,水相的体积约为所用硕盟TRIzol试剂的60%;
5. 向步骤4得到的上清水相加入等体积的异丙醇,轻轻混匀,室温静置10min;
6. 12,000g,4℃离心10min;
7. 小心去除上清,缓慢沿管壁加入1mL75%的乙醇(用DEPC处理过的水配制),轻轻混匀。每使用1mL硕盟TRIzol试剂至少加1mL 75%的乙醇;
8. 12,000g,4℃离心10min;
9. 小心吸尽上清;
10.室温干燥沉淀2~5min(不可晾得太干,否则RNA将会很难溶解),加入30~50μL的无RNase水溶解RNA沉淀,待完全溶解后于-70℃保存。取RNA样品用1×TE Buffer(见备注)稀释样品100倍或适当的倍数,测定样品在260nm和280 nm的吸收值确定RNA的质量。
RNA的浓度=OD260×稀释倍数×0.04μg/μL,OD260/280 在1.8~2.1视为抽提的RNA的纯度很高。
四、注意事项
本试剂含强变性剂
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