手性中心手性碳原子.pptVIP

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手性中心手性碳原子

* * Lambert-Beer’s law: A=Log Io/I = ecl e, extinction coefficient; c, concentration; l, optical length * 丝氨酸 苏氨酸 半胱氨酸 天冬酰胺 谷氨酰胺 Q * Cystine is dimer of cysteine * K 赖氨酸 精氨酸 组氨酸 * D 天冬氨酸 E 谷氨酸 * Nature may yet surprise us with more directly encoded amino acids. Selenocysteine: encoded by the RNA nucleotide triplet UGA found in Archaea, eubacteria and animals including mammals. Pyrrolysine: encoded by the RNA nucleotide triplet UAG, found in Archaea, and eubacteria. Science (2002) vol. 296, 1409; 1459; 1462 Two rare standard AAs * Two rare standard AAs * in collagen (胶原) in collagen (胶原) in myosin(肌球蛋白) in prothrombin (凝血酶原) Some in certain proteins (由蛋白质中的某些氨基酸经修饰而成) Nonstandard AAs (1) * 鸟氨酸 瓜氨酸 Nonstandard AAs (2) About 300 in cells, but not in proteins (e.g. ornithine/ 鸟氨酸, citrulline/瓜氨酸. 一般是蛋白质和氨基酸代谢的中间产物) * §2.3 Chemical Properties Acid-Base and Titration Curves Characteristic Reactions * Chemical properties: acid-base * A pH at which an AA has equal positive and negative charge---isoelectric point (PI). Chemical properties: isoelectric point * Chemical properties: titration curves (1) * Chemical properties: titration curves (2) * Chemical properties: titration curves (3) * * (水合)茚三酮 Characteristic Reactions * 荧光胺 丹磺酰氯 二硝基氟苯 * The End * * * * * * * * * * * * * * §2.1 手性分子与旋光性 §2.2 氨基酸的结构特征 §2.3 氨基酸的种类 §2.3 氨基酸的主要化学性质 §2 氨基酸/Amino Acids * 1.分子结构及其表示 2.分子结构的影响因素与同分异构 3. 旋光异构与手性 4. 旋光构型的标记 §2.1 手性分子与旋光性 * projection formulas 费歇尔(Fischer)投影式 Perspective formulas 1.分子结构及其表示 分子结构是指一个分子的组成原子(基团)通过价键连接和空间排列所形成的几何形象 * 2.分子结构的影响因素与同分异构 决定分子几何形象的因素 1. 当然与其组成原子(基团)的性质和数量有关系 2. 同分异构(三个层次) (1)原子(基团)间的连接方式(构造方式),不同构造方式产生构造异构; (2)在构造方式一定的情况下,由价键在空间的排列方式所规定的原子(基团)在空间的排列方式称为构型,不同的构型产生构型异构; (3)在构造或构型一定的情况下,由单键的旋转引起的单键相连原子(基团)在空间的各种排列方式称为构象,不同的构象产生构象异构; (4)上述三个因素不一定同时存在。 * 构型 (Configuration) 和构象 (Conformation) 构型:分子中由于各原子或基团间特有的固定的空间排列方式; 一种构型转变另一种构型则要求共价键的断裂、原子(基团)间的重排和新共价键的重新形成。 构象:广义的构象是指分子中原子或基团在三维空间的取向和定位;狭义的构象是指具有相同构造和构型分子中,由于某个原子

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