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HyperChem 程序及其应用
1、绘制丙二烯分子骨架模型,并测量有关分子构型的几何信息
2、指定输出文件File---Start Log。
先用半经验方法进行分子优化,从Setup中选择Semi-empirical…设定参数如下所示
(2)选择Options…可设置收敛限和迭代次数,如下所示:
(3)从Compute中选择Geometry Optimzation…进行集合构型优化:
(4)优化完成之后,在Compute选择Single Point可进行单点计算。
3、采用从头算的方法:
(1)Setup中选择Ab Initio…设定参数如下:
从Compute中选择Geometry Optimzation…进行集合构型优化:
(3)完成集合构型优化后,从Compute选择Single Point可进行单点计算。
4、计算结束后,停止数据输出,从File---Stop Log。
5、分析有关分子的性质并简单分析讨论分子性质
(1)采用从头算方法后,分析振动光谱:(该图显示谱线的位置、强度和振动模式)
虚振动频率-185.84意味着,此结构不是一个稳定结构,而是一个过渡态。
(2)计算电子光谱
最低能量跃迁π-π*在373.90,是禁阻跃迁
允许的跃迁是116.84单态π-π*跃迁。
(3)分子偶极矩
轨道特征
1、最高占据轨道
2、最低空轨道
绘分子图,测电子光谱从Comput选择Plot Molecular Graphs
1、2D图像
2、3D图像
6、结论与经验
丙烯分子为一平面型分子,并且其振动频率存在虚频-185.84,意味着此平面结构不是一个稳定结构,而是一个过渡态。
半经验算法计算分子总能量为-16180.6852898 (kcal/mol),从头算方法计算分子总能量为-72576.4084722 (kcal/mol),所以计算方法的选择很重要。
计算分子的电子光谱能够得到
该分子最低能量跃迁π-π*在373.90,是禁阻跃迁;允许的跃迁是116.84单态π-π*跃迁。
4、 HyperChem量子化学的程序还可用于计算分子性质
(1)该程序包含有实验数据构成的数据库(键长、键角、二面角等),可以迅速构成分子体系骨架,建立起2D、3D分子模型。(2)可以输出图形化的计算结果,如分子轨道、静电势的图形、总电荷密度的分布、总自旋密度的图形等等。(3)可以计算输出分子的静态性质,包括势能、势能的梯度、静电势、分子轨道能量、基态、激发态分子轨道波函数、振动分析、振动频率、振动模式、红外吸收强度、自旋密度-ESR光谱的耦合常数、预测化学反应的位置、说明化学反应的途径和机制、解释分子的动力学行为等等。
HyperChem log start -- Fri Dec 09 13:48:10 2011.
Geometry optimization, SemiEmpirical, molecule = (untitled).
CNDO
PolakRibiere optimizer
Convergence limit = 0.0001000 Iteration limit = 50
Accelerate convergence = YES
Optimization algorithm = Polak-Ribiere
Criterion of RMS gradient = 0.1000 kcal/(A mol) Maximum cycles = 135
RHF Calculation:
Singlet state calculation
Number of electrons = 18
Number of Double Occupied Levels = 9
Charge on the System = 0
Total Orbitals = 18
Starting CNDO calculation with 18 orbitals
E=0.0000 Grad=0.000 Conv=NO(0 cycles 0 points) [Iter=1 Diff=5763.16792]
E=0.0000 Grad=0.000 Conv=NO(0 cycles 0 points) [Iter=2 Diff=3.45049]
E=0.0000 Grad=0.000 Conv=NO(0 cycles 0 points) [Iter=3 Diff=0.25510]
E=0.0000 Grad=0.000 Conv=NO(0 cycles 0 points) [Iter=4 Diff=0.02325]
E=0.0000 Gra
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