【2017年整理】数据搜索时有用的生物大分子数据库扫描.docVIP

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  • 2017-01-22 发布于浙江
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【2017年整理】数据搜索时有用的生物大分子数据库扫描.doc

【2017年整理】数据搜索时有用的生物大分子数据库扫描

生物大分子数据库扫描 根据“Nucleic Acids Research”最新(指2007年)公布的数据,目前已有968个有关生物大分子数据库(参见文献 Galperin M Y, The Molecular Biology Database Collection, 2007, 35: D3)。有兴趣的读者可以参阅网站“/nar/database/a”。我们这里将主要类型的数据库列于表4-2。 数据库类别 代表数据库名及应用 核苷酸序列数据库 国际苷酸序列数据库集 DDBJ:所有已知的核苷酸序列与蛋白质序列 EMBL:所有已知的核苷酸序列与蛋白质序列 GenBank:所有已知的核苷酸序列与蛋白质序列 DNA序列:基因,保守序列模式及调控位点 有关代码DNA序列 ACLAME:基因移动因子分类数据库 CUTG:Genbank数据库中的代码应用分类数据库 HERVd:人类内源性逆转录病毒数据库 NPRD:核小体定位区间数据库 TIGR Gene Indices:基因序列与组织专一化数据库 VectorDB:核酸向特征及分类数据库 基因结构,内含子,外显子 ASD:选择性剪切数据库 EASED:扩展选择性剪切EST数据库 HS3D:现代人剪切位点数据库 Splice DB:典型与非典型的哺乳动物剪切位点数据库 转录调节位点与转录因子 ACTIVITY:功能DNA/

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