国家科学技术奖推荐项目公示.doc-湖北省农业科学院.doc

湖北省农科院2017年度国家科学技术奖推荐项目公示 　　 按国家科学技术奖励工作办公室关于2017年度国家科学技术奖励推荐工作的通知（国科奖字〔2016〕41号）精神，经组织单位申报并评审，我院现推荐“整合组学基因挖掘技术体系建立及在优质猪育种中的应用”项目申报2017年度国家技术发明奖。现将推荐项目予以公示，公示期为10天（至1月10日）。任何单位和个人若对推荐项目有异议，可按下述联系方式实名反映。 　　附件：推荐2017年度国家科学技术奖励项目 　　联 系 人：李飞 张兴中 　　联系电话：027电子邮箱：334637511@ 2016年12月30日? 拟推荐2017年度国家科学技术奖励项目 项目名称 整合组学基因挖掘技术体系建立及在优质猪育种中的应用 推荐单位 湖北省 项目简介： 本项目属于畜牧学科养殖业家畜育种技术领域。 我国是世界第一养猪大国，培育优质种猪对于推动我国现代养猪业转型升级及可持续发展具有重要战略意义。本项目围绕“优质绿色健康养殖”理念，针对养猪生产中优质健康种猪改良分子育种标记挖掘技术体系需要创新及标记缺乏等问题，在优质猪育种相关技术发明及其应用方面取得了重要进展。 （1）构建了基于整合组学策略的基因素材高效挖掘与分子育种标记开发技术体系 设计、建立了猪第一代QiagenOperon基因芯片（porcine AROS 1.0）的技术操作流程；优化了猪Affymetrix基因芯片的非特异过滤方法；创新了一系列适用于大数据全基因组关联分析（GWAS）的新算法，开发出广泛应用的工具FarmCPU和GAPIT2；开发了猪基因组编辑系统的sgRNA设计及脱靶效应评估软件、sgRNA表达载体测序序列同源比对工具、miRNA定量表达检测引物和寡核苷酸探针设计软件等并获软件著作权；创建了多个病毒和细菌刺激及肌肉发育的细胞和活体模型，通过多层次组学联合分析的整合组学创新思路，发展了猪多层次组学研究技术，实现了猪基因素材高效挖掘平台与分子育种标记开发技术体系的构建。 （2）开发了一批用于优质健康猪培育、具有自主知识产权的分子育种标记 建立了大白猪、恩施黑猪、以及杜洛克×二花脸 F2 猪群等产肉、抗病性状研究的多个资源群体，应用多层次整合组学技术筛选出猪重要候选基因近600个，鉴定了猪骨骼肌生长发育、猪免疫器官和细胞响应不同刺激物的重要功能基因和基因网络/信号通路，鉴定出与产肉、免疫性状显著关联的基因突变30多个，开发出多个具有自主知识产权的分子育种标记，获授权国家发明专利24件（含10件核心国家发明专利与14件相关国家发明专利）。 （3）构建了适用于优质猪培育的新型育种技术体系，社会经济效益显著 创新性地提出了“系统数量遗传学”，以此为基础提出了基于分层混合线性模型（SMLM）的优质猪的育种值评估模型，制定了1套适合于优质母本新品系的种猪综合选择指数，构建了优质猪新型育种技术体系。培育了1个湖北优质猪新品系和2个三元杂优配套组合，完成了以恩施黑猪为基础的“硒都黑”优质猪配套系4个世代选育。通过与各公司实情相匹配的个性化推广应用方案，在全国10余家公司推广应用，新增利润超过1亿元，取得了显著经济及社会效益。 项目获得24项发明专利、3项软件著作权和1项恩施黑猪肉国家地理标志保护产品证书，并开发GWAS分析软件2套。在Plos Genetics等国内外权威刊物发表论文60余篇，他引超过700次，研究成果被《Diseases of Swine》等多部国际经典专著引用和介绍，并应邀参与国际猪基因组计划和ENCODE计划。本项目实现了猪重要性状基因的批量挖掘与验证，开发出一批分子育种标记，建立了优质健康猪的新型育种技术体系，推动了我国猪育种技术和种质创新的发展，促进了我国养猪业的科技进步。 客观评价： （一）论文被广泛引用 根据文献检索报告结果，本项目共发表相关研究论文60余篇，其中SCI论文50多篇，论文先后被NATURE REVIEWS MOLECULAR CELL BIOLOGY、NUCLEIC ACIDS RESEARCH等杂志他引700多次。本项目成果相继被国外多部教材和专著引用，世界养猪业和猪病研究领域的经典著作《Diseases of Swine》最新版（第十版）在55章中整段详细介绍了本项目的成果（BMC Genomics. 2009; 10:64）；解析miRNA调控骨骼肌发育机制的成果被《Regenerative Medicine for Degenerative Muscle Diseases》引用（Cell Death Dis. 2013;4:e668）；本项目提出“系统数量遗传学”的文章，被国外植物遗传育种领域优秀教材《Principles of Pl