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生物进化研究方法 生物进化研究方法 生物进化研究方法 分子进化的模式 DNA突变的模式：替代，插入，缺失，倒位 (2) 核苷酸替代：转换 (Transition) 颠换 (Transversion) (3) 基因复制：多基因家族的产生以及伪基因的产生 A. 单个基因复制 – 重组或者逆转录 B. 染色体片断复制 C. 基因组复制 (1) 从物种的一些分子特性出发，构建系统发育树，进而了解物种之间的生物系统发生的关系 ——生命树，物种分类 (2) 大分子功能与结构的分析：同一家族的大分子，具有相似的三级结构及生化功能，通过序列同源性分析，进行大分子功能预测 (3) 进化速率分析：例如，HIV的高突变性，哪些位点易发生突变？ (1) Tree of Life: 16S rRNA Out of Africa 系统发育树是一种二叉树。由一系列节点（nodes）和分支（branches ）组成，其中每个节点代表一个分类单元（物种或序列），而节点之间的连线代表物种之间的进化关系。 树的节点又分为外部节点（terminal node）和内部节点（internal node）。外部节点代表实际观察到的分类单元。内部节点又称为分支点，代表分类单元进化历程中的祖先。 选择一个或多个已知与分析序列关系较远的序列作为外围支 2. 外围支可以辅助定位树根 3. 外围支条件：序列必须与剩余序