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芯片技术-徐翔丽幻灯片
生物芯片技术 徐翔丽 生物芯片是指通过机器人自动打印或光引导化学合成技术在硅片、玻璃、凝胶或尼龙膜上制造的高密度的组织、细胞、蛋白质、核酸、糖类以及其它生物组分的微点阵。 芯片与标记的样品进行杂交,通过检测杂交信号即可实现对生物样品的分析。 基因芯片 蛋白质芯片 芯片实验室 蛋白质芯片, 又称蛋白质阵列或蛋白质微阵列,是指以蛋白质分子作为配基,将其有序地固定在固相载体的表面形成微阵列;用标记了荧光的蛋白质或其他它分子与之作用,洗去未结合的成分,经荧光扫描等检测方式测定芯片上各点的荧光强度,来分析蛋白之间或蛋白与其它分子之间的相互作用关系。 蛋白质芯片 DNA芯片与蛋白芯片最大的区别是靶分子和探针分子的结构差异 相对于DNA 芯片, 蛋白质芯片技术面临更多困难。 第一, 相对于DNA 的碱基配对杂交机制, 蛋白质之间的相互作用呈现出更强的变化性。而且, 蛋白质的活性以及相互作用的性质可能需要其它蛋白质的作用和翻译后修饰。 第二, 相对于PCR 技术这样可以大量扩增DNA 的技术, 尚未有可以大量扩增蛋白质的成熟技术。 第三, 蛋白质的表达和纯化工作十分艰巨, 而且经常不能保持蛋白质的完整功能。 最后, 许多蛋白质很不稳定, 给阵列制作本身带来很大的困难 蛋白质是基因表达的最终产物, 接近生命活动的物质层面; 探针蛋白特异性高、亲和力强, 可简化样品前处理,甚至可直接利用生物材料(血样、尿样、细胞及组织等)进行检测; 适合高通量筛选与靶蛋白作用的化合物; 有助于了解药物或毒物与其效应相关蛋白质的相互作用。 研究蛋白质芯片的意义 蛋白质芯片的分类 一、按制作方法和用途分类 蛋 白 质 检 测 芯 片 主要包括抗体芯片、抗原芯片、配体芯片、碳水化合物芯片等。它是将具有高度亲和特异性的探针分子 ( 如单克隆抗 体 ) 固定在基片上 , 用以识别复杂生物样品溶液 ( 如细胞提取物 ) 中的目标多肽 , 当放射性同位素或荧光标记的靶分子与芯片上的探针分子结合后 , 通过激光共聚焦扫描或电荷耦合检测装置 (CCD) 对信号的强度进行检测 , 从而判断样品中靶分子的数量。 蛋 白 质 功 能 芯 片 它是将所研究体系中的每种天然蛋白质点加在基片上制成芯片,用于天然蛋白质活性及分子亲和性的高通量平行研究。要了解体系中有哪些蛋白质能与蛋白质结合 , 则将制成的蛋白质功能芯片与荧光标记的蛋白质温育 , 经荧光显微镜扫描检测可知 , 芯片上的亮点即为蛋白质的潜在结合物。蛋白质功能芯片主要用来检测蛋白质的生物学活性。 二、根据检测试剂类型 抗体芯片、蛋白质芯片、肽芯片、适配体芯片、小分子芯片等。为了检测自身抗体,自身抗原也被也被用做检测试剂,这一类蛋白质芯片叫做抗原芯片。 三、根据密度分类 低密度蛋白质芯片、高密度蛋白质芯片。 四、根据样本分类 蛋白质芯片能够从不同的生物样品中测出单一的蛋白质,因此蛋白质芯片又被称为细胞溶解物蛋白质芯片、条件化培养基蛋白质芯片、血清蛋白质芯片、反相蛋白质芯片等。 Quantitative analysis of human serum leptin using a nanoarray protein chip based on single-molecule sandwich immunoassay Talanta 78 (2009) 608–612 We report a method for the quantitative analysis of human serum leptin, which is a protein hormone asso-ciated with obesity, using a nanoarray protein chip based on a single-molecule sandwich immunoassay.The nanoarray patterning of a biotin-probe with a spot diameter of 150 nm on a self-assembled mono-layer functionalized by MPTMS on a glass substrate was successfully accomplished using atomic force microscopy (AFM)-based dip-pen nanolithography (DPN). Unlabeled leptin protein molecules in human serum were detected based on the sandwich fluorescence immunoassay by total i
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