miRNA-dependentgenesilencinginvolvingAgo2-mediatedcleavageofacircularantisenseRNA.doc

miRNA依赖基因沉默涉及了Ago2介导环形反义RNA的裂解 Thomas B Hansen1, Erik D Wiklund1,2,Jesper B Bramsen1, Sune B Villadsen1,Aaron L Statham2, Susan J Clark2 and J^rgen Kjems1,* 奥尔胡斯，奥胡斯大学，跨学科纳米科学中心（稻野），分子生物学系；以及澳大利亚，新南威尔士州，达令赫斯特，利亚伽尔文医学研究所，丹麦和实验胚胎学实验室，癌症计划。 microRNA（miRNAs）是大约22 个核苷酸长度的非编码RNA，其绑定在细胞质中靶点mRNA的3’端UTR(非编码区)上，导致mRNA的不稳定性和转录的抑制。我们在这里表明了miRNA也可以通过靶向人类细胞中长非编码翻译转录来调控基因表达。具体来说，我们说明了在Ago2切片机依赖性的方式下，miR-671可以直接裂解小脑变性相关蛋白1（CDR1）的环形反义转录。环形反义伴随着CDR1的 mRNA水平的减少而产生下调的结果，并形成异染色质的独立性。这项研究为非编码反义转录作为功能化的miRNA靶点提供了第一手的证据，以及一种涉及到mRNA和反义环状RNA水平之间的正相关关系的新型调节机制。 EMBO杂志（2011）30，4414-4422。 DOI：10.1038/ emboj.2011.359；9月30日在线发表 主题分类：RNA 关键词：CDR1；环状RNA ；miR-671；天然的反义转录；细胞核的microRNA 简介 众所周知，通过结合细胞质中mRNAs靶点的3’端UTR上，microRNA（miRNA）可以调控基因的表达，从而导致mRNA的不稳定性和抑制转录（堪富利士等人，2005年；皮莱等人，2005年；Petersen等人，2006年；Chendrimada等人，20007年）。越来越明显的是miRNA在一定程度上涉及大多数而非所有由细胞组成的路径，并且解除miRNA的表达模式是疾病的标志性，如癌症（GUIL Esteller，2009）。在某些情况下，也证明了，以RNAi相似的方式，microRNA由Ago2的依赖性裂解具有近乎完美的互补的miRNA靶位点的mRNA，（Hutvagner和Zamore等人，2002年，2004年），以及某些miRNA可能在5’端非编码区和mRNA的ORF上通过靶点发挥作用（福尔曼等人，2008; OROM等，2008; Tay等，2008）。另外，在人体细胞的细胞核中也能检测到功能化的RISC活性（(Langlois等人，2005； Robb等人，2005），同时miRNA是细胞核的主要的一个子集（Hwang等人，2007年；Liao等人，2010年），表明了小分子RNA可以具有多种不同的生物学功能不同于标准的3’端非编码区靶点mRNA抑制。 在裂变酵母和植物中，针对启动子区域来说，siRNAs干扰通过指导本地异染色质形成来诱导RNAi依赖性转录基因沉默（TGS）（VERDEL等，2009）。同时已经证明了启动子靶点的siRNA在培养的人类的细胞株上能够诱导TGS（Morris等人，2004年），最近内性源的哺乳动物TGS的机制已经提到了 miRNAs（Gonzalez等人，2008; Kim等，2008）。在人体细胞中，siRNA是经常伴随着H3K27和/或H3K9甲基化指导 TGS，同时兼偶尔有DNA甲基化（Svoboda等，2004年；Suzuki等人，2005年；Ting等人，2005年；Weinberg 等人，2006年； Hawkins等人，2009）。这也与Argonaute蛋白的本地化增加到染色体的DNA有关，符合miRNA机制的一个可能性作用，但是潜在的机制是很少被理解的（Janowski等人，2006年；Kim等人，2006年； Gonzalez等人，2008年）。非编码转录围绕靶点启动子似乎是需要的，和siRNA 可能通过RNA和RNA之间在细胞核中的相互作用指导这个作用（Han等人，2007年；Schwartz等人，2008年；Napoli等人，2009年）。 在最近几年高通量技术已导致大量的基因近端检测和反义非编码转录的发现。天然的反义转录（NAT）涉及到了基因重叠反义转录，70% 发现在小鼠的蛋白编码的基因上（Katayama等人，2005年），表明广泛的重要的调控作用。大多数NAT与基因沉默有关，但是最近的活化作用的报告证明了正义和反义之间的水平关系更为复杂（Katayama等人，2005；Morris等人，2008）。已经提出了几种NAT基因调控机制，包括：（I）通过阻塞mRNA与核糖体的关联抑制翻译（Ebralidze等人，2008