第七章 白质功能分析与结构预测.pptVIP

第七章 蛋白质功能分析与结构预测 蛋白质功能分析 蛋白质功能预测 新基因的可能功能 已经了解到神经纤维素nf1基因的突变 与遗传性的多发性神经纤维瘤Ⅰ型疾病有关（neurofibromatosis 1）； 但关于该疾病的分子机制知之甚少。 序列相似性分析发现 NF1 与酵母的IRA蛋白同源，该蛋白是一个GTP酶活性调控蛋白(GTPase activating protein) ，也已经知道在酵母细胞中其调控GTP酶Ras的活性。 推断: NF1在人细胞中可能调控Ras蛋白； 然后进一步可以用生物实验加以验证。 蛋白质功能预测方法 基于同源序列的蛋白质功能预测 基于结构域（模体）的蛋白质功能预测 基于空间结构的蛋白质功能预测 基于相互作用的蛋白质功能预测 基于同源序列的蛋白质功能预测 蛋白质A具有转录功能，蛋白质B与A在氨基酸序列上同源（直系同源），因而蛋白质B也具有转录功能。 序列相似性比较作为一个非常有效的工具用于同源基因的发现 基于结构域（模体）的蛋白质功能预测 一类基因具有转录功能， 且它们所编码的蛋白质都具有Y结构域（模体），蛋白质B也具有Y结构域（模体），因而蛋白质B的功能也应该与基因转录相关。 蛋白质模体或结构域在氨基酸序列水平比其他区域保守，通过对序列比对可以发现这些在进化上较为保守的区域； 蛋白质模体或结构域通常与该蛋白质的功能直接相关； 根据模体或结构域