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分子生物学 杨孝朴 第六章 基因表达的调控 我们知道，所有生物的遗传信息都是以基因的形式储藏在DNA（或RNA）分子中的。随着个体的发育，DNA分子能有序地将其所承载的遗传信息通过密码子与反密码子系统转变成蛋白质分子，执行各种生理生化功能，完成生命的全过程。 我们把从DNA到蛋白质的过程称为基因表达，对这个过程的调节就称为基因表达调控。 基因表达的调控是现阶段分子生物学研究的中心课题。要了解动、植物生长发育的规律、形态结构特征和生物学功能，就必须弄清楚基因表达调控的时间和空间概念，掌握基因表达调控的秘密。 原核生物和单细胞真核生物直接暴露在变幻莫测的环境中，食物供应毫无保障，只有根据环境条件的改变合成不同的蛋白质，使代谢过程适应环境的变化，才能维持自身的生存和繁衍。高等真核生物代谢途经和食物来源比较稳定，但由于它们是多细胞有机体，在个体发育过程中出现细胞分化，形成各种组织和器官，而不同的细胞所合成的蛋白质在质和量上是不同的，而且在不同的发育过程中表达不同的基因，合成不同的蛋白质。 因此，不论是原核生物还是真核生物都有一套准确的调节基因表达和蛋白质合成的机制。 基因表达的调控主要表现为：①转录水平上的调控；②mRNA加工成熟水平上的调控；③翻译水平上的调控等等。 基因调控的指挥系统也是多样的，不同的生物使用不同的信号来指挥基因调控。 原核生物中，营养状况和环境因素对基因表达的调控有着举足轻重的影响。 真核生物尤其是高等真核生物中，激素水平和发育阶段是基因表达调控的最主要手段，营养和环境因素的影响力大为下降。 到目前为止，原核生物基因表达调控的研究已经相当彻底，许多问题已经解决，而对真核生物基因表达调控的研究还刚刚开始，不少情况下人们只能以原核生物中学到的知识来推测真核生物的机理。其次，为了更好地了解真核生物基因调控机理的复杂性，也很有必要看看原核生物的情况。所以在这一章中我们先介绍原核生物基因表达的调控。 1．原核生物基因表达调控原理 原核生物细胞的基因和蛋白质种类较少，如大肠杆菌基因组约为4×106bp，假如平均每个基因长1000bp，一个细胞就有4000个左右的基因，能合成4000种左右的蛋白质。据估计，一个细胞中总共含有107个蛋白质分子，如果每个基因都等同翻译的话，任何一个多肽应有2500个拷贝，但是这些蛋白质并不是以相同拷贝数存在于细胞中的。 有些蛋白质的数目相当固定。例如，每个大肠杆菌细胞可以有约15000个核糖体，与其结合的约50种核糖体蛋白质数量是十分稳定的。糖分解体系的酶含量很大，其数目也极恒定。此外，DNA聚合酶、RNA聚合酶等都有是代谢过程中十分必需的酶或蛋白质，其合成速率不受环境变化或代谢状态的影响。 在正常情况下经常合成的蛋白质称为永久型蛋白质。 另一类蛋白质的合成速率明显受环境的影响。例如，一般情况下，一个大肠杆菌中只有1～5个分子的β-半乳糖苷酶，但若将细胞培养在只含乳糖的培养基中，每个细胞中这种酶的数量可高达几万个分子。其他糖代谢的酶、氨基酸、核苷酸合成系统的酶类，其合成速度和总量也都随培养条件的变化而改变。 合成速率明显受环境的影响蛋白质称为适应型或调节型蛋白质。 细菌所利用的调节机制主要是转录水平的调控，即一个体系的基因在需要时被打开，大量合成mRNA，从而合成大量的蛋白质；不需要时被关闭。 所谓关闭并不是说干脆不合成mRNA，而是只合成极少量的mRNA，常常是每个世代每个细胞只合成1~2个mRNA分子，因而可合成少量的蛋白质。 1.1 启动子与转录起始 转录是基因表达的关键性步骤。在RNA聚合酶作用下，转录从一个特异的起点开始，按照碱基配对原则准确地转录DNA序列，到特异的终止部位结束，合成出一条RNA链。 为RNA聚合酶提供识别、结合和开始转录信号的一段DNA序列称为启动子（promoter）。提供转录终止信号的一段DNA序列称为终止子（terminator）。从启动子开始到终止子结束的DNA序列称为转录单元。 在细菌中，一个转录单元可以是一个基因，也可以是几个基因。 转录是由RNA聚合酶催化完成的。原核生物的RNA聚合酶全酶由五个亚基组成，可表示为“α2ββ′σ”。没有σ因子的酶叫做核心酶，可表示为“α2ββ′”。σ因子（σ亚基）的功能在于识别启动子，并使RNA聚合酶全酶能稳定地结合到DNA的启动子上。单独的核心酶也能与DNA结合，但不能找到模板DNA上的起始位点，因为没有固定的起始位点，而且两条链都可以作为模板，所以合成的产物是不均一的。 σ因子能够改变RNA聚合酶与DNA之间的亲合力，它极大地减少了酶与一般序列的结合常数和停留时间，同时又极大地增加了酶与DNA启动子的结合常数和停留时间。这样就使得全酶能迅速地找到启动子并与之相结合。所以，只有带有σ因子的全