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高级生化复习参考
高级生化复习题
一 名词解释
蛋白质的一级结构:指多肽链中氨基酸残基的数目、组成及其排列顺序(N-端→C-端),即由共价键维系的多肽链的一维(线性)结构,不涉及空间排列。在基因编码的蛋白质中,这种序列是由mRNA中的核苷酸序列决定的。主要化学键是:肽键和二硫键
蛋白质的二级结构:多肽链主链(backbone)在氢键等次级键作用下折叠成的构象单元或局部空间结构,未考虑侧链的构象和整个肽链的空间排布。主要形式:α-螺旋、β-折叠、β-转角、无规则卷曲
三级结构:指整个肽链的氨基酸残基侧链基团互相作用以及与环境间的相互作用下形成的三维结构。
蛋白质的四级结构:蛋白质分子中各具有三级结构的亚基在次级键作用下结合而成的空间排布及亚基接触部位的布局和相互作用,称为蛋白质的四级结构。亚基之间的结合力主要是疏水作用,其次是氢键和离子键。
超二级结构是:两个或多个相邻的构象元件被长度、走向不规则的连接肽彼此连接,进一步组合成有规律的、空间上可以辨认的局部折叠。主要有αα、 βαβ 、βββ等。
蛋白质卷曲密码:多肽链的氨基酸序列包含指导其折叠成天然构象的信息,称为蛋白质卷曲密码或立体化学密码。
密码子:mRNA分子中每相邻的三个核苷酸编成一组,在蛋白质合成时,代表某一种氨基酸。
组蛋白密码或蛋白质修饰密码:组蛋白的共价修饰后,其中包涵着调控染色质结构和基因表达的信息。
蛋白质泛素化:指泛素分子在一系列酶作用下,对靶蛋白进行特异性修饰的过程。多泛肽化的靶蛋白可被26S蛋白酶体识别并迅速降解。
蛋白质SUMO化:一种类似于泛素化的过程,是在一系列酶作用下,将其羧基端结合于靶蛋白的赖氨酸残基ε-氨基上,对靶蛋白进行特异性修饰的过程。SUMO化修饰参与细胞周期运转的调节,维持基因组的完整性,对泛素化的颉抗作用,转录调节等。
结构域(domain) :大分子蛋白质的三级结构常可分割成一个或数个结构紧密的空间上可以辨认的的三维实体,折叠较为紧密,各行使其功能,称为结构域。是独立的结构单位、独立的功能单位和独立的折叠单位。
SH2结构域:最先发现于Src家族蛋白质酪氨酸激酶,由大约100个氨基酸组成,两侧为两个α-螺旋,中间是由5个短的β-股形成的两个片层,特异性结合磷酸化的酪氨酸残基。SH2结构域识别的特异性取决于靶分子磷酸化酪氨酸残基及其羧基一侧3~5个氨基酸,特别是+3位置必须是疏水性氨基酸残基。
膜脂相变温度:是指膜脂发生相态转变的温度。在相变温度时,膜脂的流动性会随之改变,由液相转变为凝胶相或由凝胶相转变为液相。
竞争性抑制:抑制剂与底物竞争与酶的同一活性中心结合,从而干扰了酶与底物的结合,使酶的催化活性降低,这种作用就称为竞争性抑制作用。其特点为:a.竞争性抑制剂往往是酶的底物类似物或反应产物;b.抑制剂与酶的结合部位与底物与酶的结合部位相同;c.抑制剂浓度越大,则抑制作用越大;但增加底物浓度可使抑制程度减小;d.动力学参数:Km值增大,Vm值不变。
反竞争性抑制:抑制剂不能与游离酶结合,但可与ES复合物结合并阻止产物生成,使酶的催化活性降低,称酶的反竞争性抑制。其特点为:a.抑制剂与底物可同时与酶的不同部位结合;b.必须有底物存在,抑制剂才能对酶产生抑制作用;c.动力学参数:Km减小,Vm降低。 非竞争性抑制:抑制剂既可以与游离酶结合,也可以与ES复合物结合,使酶的催化活性降低,称为非竞争性抑制。其特点为:a.底物和抑制剂分别独立地与酶的不同部位相结合;b.抑制剂对酶与底物的结合无影响,故底物浓度的改变对抑制程度无影响;c.动力学参数:Km值不变,Vm值降低。 分子量只有20~30KD,同样具有GTP酶活性,在多种细胞反应中具有开关作用。聚合酶链式反应PCR):体外酶促合成特异DNA片段的一种方法,由高温变性、低温退火及适温延伸等几步反应组成一个周期,循环进行,使目的DNA得以迅速扩增,具有特异性强、灵敏度高、操作简便、省时等特点。
RT-PCR:聚合酶链式反应(PCR)的一种广泛应用的变形。在RT-PCR中,一条RNA链被逆转录成为互补DNA,再以此为模板通过PCR进行DNA扩增。
Southern blotting:进行基因组DNA特定序列定位的通用方法。一般利用琼脂糖凝胶电泳分离经限制性内切酶消化的DNA片段,将胶上的DNA变性并在原位将单链DNA片段转移至尼龙膜或其他固相支持物上,经干烤或者紫外线照射固定,再与相对应结构的标记探针进行杂交,用放射自显影或酶反应显色,从而检测特定DNA分子的含量。
Northern blotting:是利用DNA可以与RNA进行分子杂交来检测特异性RNA的技术,首先将RNA混合物按它们的大小和分子量通过琼脂糖凝胶电泳进行分离,分离出来的RNA转至尼龙膜或硝酸纤维素膜上,再与放射性标记的探针杂交,通过杂交
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