主成分分析法.ppt

6.1 主成分分析 6.1.1 主成分分析的概念与步骤 6.1.2 使用INSIGHT模块作主成分分析 6.1.3 使用“分析家”作主成分分析 6.1.1 主成分分析的概念与步骤 1. 主成分分析基本思想 主成分分析是数学上对数据降维的一种方法。其基本思想是设法将原来众多的具有一定相关性的指标（比如p个指标），重新组合成一组新的互不相关的综合指标来代替原来指标。通常数学上的处理就是将原来p个指标作线性组合，作为新的综合指标。但是这种线性组合，如果不加限制，则可以有很多，应该如何去选取呢？ 在所有的线性组合中所选取的F1应该是方差最大的，故称F1为第一主成分。如果第一主成分不足以代表原来p个指标的信息，再考虑选取F2即选第二个线性组合。为了有效地反映原有信息，F1已有的信息就不需要再出现在F2中，用数学语言表达就是要求Cov(F1，F2)＝0。称F2为第二主成分，依此类推可以构造出第三、第四、…、第p个主成分。 2. 主成分分析的数学模型 设有n个样品（多元观测值），每个样品观测p项指标（变量）：X1，X2，…，Xp，得到原始数据资料阵： 其中Xi = (x1i，x2i，…，xni)'，i = 1，2，…，p。 用数据矩阵X的p个列向量（即p个指标向量）X1，X2，…，Xp作线性组合，得综合指标向量： 简写成： Fi = a1iX1 + a2iX2 +…+apiXp i = 1，2，…，p 为了加以限制，对组合系数ai' = (a1i，a2i，…，api)作如下要求： 即：ai为单位向量：ai'ai = 1，且由下列原则决定： 1) Fi与Fj（i≠j, i, j = 1, …, p）互不相关，即Cov(Fi，Fj) = 0,并有Var(Fi)=ai'Σai，其中Σ为X的协方差阵 2) F1是X1，X2，…，Xp的一切线性组合（系数满足上述要求）中方差最大的，即 ，其中c = (c1，c2，…，cp)' F2是与F1不相关的X1，X2，…，Xp一切线性组合中方差最大的，…，Fp是与F1，F2，…，Fp-1都不相关的X1，X2，…，Xp的一切线性组合中方差最大的。 满足上述要求的综合指标向量F1，F2，…，Fp就是主成分，这p个主成分从原始指标所提供的信息总量中所提取的信息量依次递减，每一个主成分所提取的信息量用方差来度量，主成分方差的贡献就等于原指标相关系数矩阵相应的特征值?i，每一个主成分的组合系数 ai' = (a1i，a2i，…，api) 就是相应特征值?i所对应的单位特征向量ti。方差的贡献率为 ，?i越大，说明相应的主成分反映综合信息的能力越强。 3. 主成分分析的步骤 (1) 计算协方差矩阵 计算样品数据的协方差矩阵：Σ = (sij)p?p，其中 i，j = 1，2，…，p (2) 求出Σ的特征值及相应的特征向量 求出协方差矩阵Σ的特征值?1??2?…?p>0及相应的正交化单位特征向量： 则X的第i个主成分为Fi = ai'X i = 1，2，…，p。 (3) 选择主成分 在已确定的全部p个主成分中合理选择m个来实现最终的评价分析。一般用方差贡献率 解释主成分Fi所反映的信息量的大小，m的确定以累计贡献率 达到足够大（一般在85%以上）为原则。 (4) 计算主成分得分 计算n个样品在m个主成分上的得分： i = 1，2，…，m (5) 标准化 实际应用时，指标的量纲往往不同，所以在主成分计算之前应先消除量纲的影响。消除数据的量纲有很多方法，常用方法是将原始数据标准化，即做如下数据变换： 其中 ， ，j = 1，2，…，p。标准化后的数据阵记为X*，其中每个列向量（标准化变量）的均值为0，标准差为1，数据无量纲。 标准化后变量的协方差矩阵（Covariance Matrix）Σ = (sij)p?p，即原变量的相关系数矩阵（Correlation Matrix）R= (rij)p?p： i，j = 1，2，…，p 此时n个样品在m个主成分上的得分应为： Fj = a1jX1* + a2jX2* +...+ apjXp* j = 1，2，…，m 6.1.2 使用INSIGHT模块作主