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- 2017-02-09 发布于重庆
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RealTimeRTPCR常见问题分析
Real-Time RT-PCR常见问题分析
1.某一孔荧光信号特别强
问题:同一批样品,其中某一个荧光信号特别强?
原因:① 试剂配制时反应液没完全溶化,导致探针量在一管中增多;② 试剂配制时没有充分混匀致各管中各成分的量不同;③ 也可能是PCR仪热槽被荧光物质污染,这时就要清除热槽中的污染;
2. 扩增曲线有一向上或向下的尖峰
问题:扩增曲线有一向上或向下的尖峰?
原因:① 反应过程中电压不稳定;②可能在20循环左右仪器有停下或者仪器有开盖,使得光线突然增强;③ 如果尖峰向下,也可能是卤素灯老化所致,这时应更换;
3. 部分样本扩增效率过低
问题:部分样本扩增效率过低?
原因:① 提取液残留,一定程度抑制了PCR反应;② 反应液未严格取量混匀或分装不均匀;③试剂失效;
4. 阴性对照或空白对照翘尾,可能原因:1、模板提取环境有污染。2、模板提取操作有污染。3、配液过程存在污染。
问题:阴性对照或空白对照翘尾?
原因:①模板提取环境有污染;②模板提取操作有污染;③试剂配制过程存在污染;
5. 直线型扩增曲线
问题:直线型扩增曲线?
原因:①探针部分降解(探针降解原因:a.探针反复冻融――稀释的探针可在4℃保存至少3个月,应避免反复冻融;b.探针在光线下暴露时间太长);②反应液中有PCR抑制物;
6.没有扩增曲线
问题: 没有
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