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核酸的结构ppt
定义 核酸中核苷酸的排列顺序。 由于核苷酸间的差异主要是碱基不同,所以也称为碱基序列。 Chargaff规则: (1)A=T (2)G=C (3)A+C=G+T (4)A+G=C+T 核小体由DNA链连在一起形成念珠状结构 DNA的功能 核糖核苷酸通过 3,,5,-磷酸二酯键相连形成长链 由70~90个核苷酸组成 含 10~20% 稀有碱基 3′末端为 — CCA-OH 5′末端大多数为G 具有 T?C (二)tRNA的二级结构—三叶草型模型 ①5′末端帽子结构:m7GpppN ②3′末端有多聚腺苷酸尾巴结构(polyA) ③单顺反子(一条mRNA链上有一个编码区) 酸、碱、酶水解 水解位点在磷酸二酯键和糖苷键 DNA/RNA对酸/碱的耐受程度有差别 碱性条件下,RNA可被稀碱水解;而DNA变性,但不被水解;可用此法测定RNA的碱基组成或去除RNA杂质 酸性条件下,糖苷键不稳定,嘌呤与脱氧核糖间的糖苷键最易被水解;故对核酸部分水解时,很少采用酸水解 具有芳香环结构特点,能发生酮式/烯醇式互变 碱基都具有弱碱性(主要是环内氨基的贡献) 碱基含有共轭双键,可强烈吸收250~290nm处的紫外光,最大吸收峰260nm左右 核酸紫外吸收性质的应用 可利用紫外光照相来定位测定核酸在细胞和组织中的分布 每摩尔碱基在一定PH下的紫外吸收值为定值,故利用此性质可定量碱基或碱基衍生物在纯溶液中的含量 利用碱基的紫外吸收性质可确定其在色谱和电泳谱上的位置 载体(浅蓝色荧光), 核酸区(暗区) DNA变性 完全变性后核酸紫外吸收值增加: 天然DNA 25-40%、RNA 约1.1% 实质:碱基暴露 1. 解链曲线:如果在连续加热DNA稀盐溶液的过程中以温度对A260(absorbance,A,A260代表溶液在260nm处的吸光率)值作图,所得的曲线称为解链曲线。 探针 探针技术:在核酸杂交的基础上发展起来的一种用于研究和诊断的新技术。 探针(probe):经同位素或荧光标记的具有特定碱基序列的单链核苷酸聚合体。 探针可用于:基因诊断、致病基因的定位、Southern blotting、Northern blotting、原位杂交、DNA芯片技术等临床实践和科研。 原位杂交法筛选DNA重组体图解 Southern印迹法 DNA芯片工作示意图 本 章 小 结 核酸是遗传物质载体的证明和研究历史 核酸的化学结构:戊糖、碱基(A、T、G、C、U),核苷、核苷酸及其衍生物的结构特点(原子编号) DNA的结构:一级结构(核酸序列及其表示、基因及基因组)、二级结构( 双螺旋模型、Z-DNA等)、三级结构(超螺旋、核小体)、结构维持的化学键 RNA结构与功能:碱基组成特点、RNA的种类结构及功能 核酸的性质:酸碱性、变性与复性、分子杂交 影响核酸变性的因素: 过量酸,碱,加热(一般>75℃), 变性试剂如尿素、酰胺, 某些有机溶剂(如乙醇、丙酮等) 变性后理化性质的改变: OD260增高、粘度下降、比旋度下降、 浮力密度升高、酸碱滴定曲线改变、 生物活性丧失 RNA变性:从螺旋到线团之间的转变 RNA的变性引起的性质变化没有DNA明显 核酸变性引起紫外吸收值的增加-增色效应 DNA的紫外吸收光谱 由于变性或降解引起核酸紫外吸收增加的现象称增色效应 OD260 : 单核苷酸单链DNA双链DNA (二)核酸的热变性及Tm 变性过程是“跃变式”的,而非渐变 2. Tm:变性是在一个相当窄的温度范围内完成,在这一范围内,紫外光吸收值达到最大值的50%时的温度称为DNA的解链温度,又称熔解温度(melting temperature, Tm)。其大小与G+C含量成正比。 双链RNA比双链DNA稳定,Tm高大约20 ?C 一般DNA Tm 值在85 - 90 ?C之间 3. 影响Tm的因素 G-C含量:G-C含量越高,Tm越高 经验公式:(G+C)%=(Tm-69.3)X2.44 溶液的离子浓度:浓度越低,Tm越低 离子溶液的PH PH大于11.3时,碱基不能形成氢键,DNA完全变性;PH小于5.0,DNA易脱嘌呤 变性剂:变性剂可破坏氢键,使Tm下降 五、DNA的复性 1. DNA复性(renaturation)的定义 在适当条件下,变性DNA的两条互补链可恢复天然的双螺旋构象,这一现象称为复性。 DNA复性后,一系列性质将得到恢复,但是生物活性一般只能得到部分的恢复,具有减色效应。 减色效应 DNA复性时,其紫外吸收降低 变性和复性是可逆的, 将热变性的DNA骤然冷却至
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