大规模蛋白质相互作用研究方法进展.docVIP

大规模蛋白质相互作用研究方法进展 作者：关薇等 来源：生命科学 时间：2008-10-23 关 薇, 王 建, 贺福初*（军事医学科学院放射与辐射医学研究所，北京 100850）摘　要：随着2000 年酵母大规模蛋白质相互作用网络图谱的成功描绘，蛋白质相互作用特别是大规模蛋白质相互作用研究成为生命科学领域的又一个研究热点。酵母、果蝇、线虫以及人类蛋白的大规模相互作用图谱的相继完成，不仅对系统研究细胞内各种生命活动有着重要意义，也标志着蛋白质相互作用研究方法的不断发展和完善。本文综述了当前大规模研究蛋白质相互作用的技术方法并进行了比较分析。每种技术都有其各自的优缺点，在实验中要根据不同的要求和目的选择适宜的方法。关键词：蛋白质相互作用；酵母双杂交；串联亲和纯化 The advance in research methods for large-scale protein-protein interactionsGUAN Wei, WANG Jian, HE Fu-Chu*(Beijing Institute of Radiation Medicine, Beijing 100850, China)Abstract: In 2000, the first network of large-scale protein-protein interactions was accomplished in yeast. It was a historic moment and became another hot spot of protein research. Subsequently, such proteins interaction maps were also brought to success in the fly, worm and even human during five years. So rapid progress in large-scale protein-protein interactions turned up many new angles of view for investigating the mechanisms of cell functions, actually it also suggested the development and complement of research method itself. In this article we summarized the progress of techniques in large-scale protein-protein interactions and showed their differences. Anyway, the researchers should choose right means to perform their diverse intentions.Key words: protein-protein interaction; yeast two hybrid; tandem affinity purification 人类基因组测序的完成标志着一个新的生物学研究时代——后基因组时代(post-genomic era)的来临。科学家们的研究热点又回到蛋白质上，全基因组的序列信息并不足以解释及推测细胞的各种生命现象，蛋白质才是细胞活性及功能的最终执行者。构成细胞的所有组成蛋白有多少；他们的动态相互作用关系又如何；细胞内所有蛋白即蛋白质组又是怎样组织在一起形成有功能、有秩序的网络结构？这些问题的解决才是最终阐明细胞中各种生命活动机制的关键所在[1]。1　大规模蛋白质相互作用研究的目的及意义生物体内各种生命信息由不同的基因经转录、翻译传递到相应的蛋白质上并使其具有各自的生化特性及生物学活性；但每个蛋白质并不是独立的在细胞中完成被赋予的功能，它们在细胞中通常与其他蛋白质相互作用形成大的复合体，在特定的时间和空间内完成特定的功能，而且有些蛋白质的功能只有在复合体形成后才能发挥出来，如依赖于构象变化或翻译后修饰的蛋白质功能[2] ；另一方面，某些蛋白质可能参与了不止一个的复合体，简单的两两相互作用研究就不足以阐明这种更为复杂的相互作用，因此，大规模、高通量的蛋白质相互作用研究应运而生，其目的是在细胞的特定生理条件下，从一个蛋白到多个蛋白，从一个复合体到多个复合体，进而描绘出整个蛋白质组中蛋白间相互作用的网络图。基于这些作用关系，科学家们才能从真正意义上阐明一个蛋白质的功能，才有可能研究细胞中某一生理活动中所有相关蛋白质的变化及作用机制。大规模蛋白质相互作用的研究还有助于了解细胞中不同生命