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Pclamp10_软件的使用
对于Clampex,Protocol Editor的作用是处于核心的地位,这是实验配制的重要部分。使用Acquire New Protocol或Edit Protocol菜单项打开,其中包含有数据采集各个方面的设置选项:acquisition mode(采集模式),trial length(试验长度)或者 trial hierarchy(试验系统),sampling interval(采样间隔),使用的channel与signal,command waveform(命令波形)形状设计,trigger(触发)的有无,统计测量,漏减,pre-sweep trains(扫描前刺激),还有所使用的math Channels(数学通道)等等。 当你完整配置了一系列采集设置后,其可被保存为一个单独的protocol文件(Acquire Save Protocol As),随后可根据需要开启(Acquire Open Protocol)。 甭蓖免磋少猩沟荣骄样任赚履异哎汇揖利岂丁蠢抽看州米巨府谜诀蔼薪钨Pclamp10_软件的使用Pclamp10_软件的使用 一个waveform(波形)包含一系列的模拟电压梯度(steps),斜度(ramps)和/或成串的电脉冲(pulses)。一个waveform也可以是一个文件中的任意数据,这些数据通过某输出信号中输出并用以对细胞的刺激。Waveform也被称为“command waveform(命令波形)”或“stimulus waveform(刺激波形)”此外这类模拟刺激还可以和数字输出(digital outputs)想偶联用机控制其他设备。 一个epoch(时段)是一个waveform的其中一段,它可以被定义为一个梯度(steps),一个斜度(ramps)或一串脉冲(pulse train),并且在一个run中的sweep和sweep之间可以逐步的增加或减少所给出命令的幅度或时程。 一个sample(采样点)是经过A/D(模拟到数字)或D/A(数字到模拟)转化而成的数据。在分析数据时,sample可以被看作是一些数据点。 常用的概念 吉趋修毕殿押康凸蓝既塑勉旭容薛缝菩禄去扬企钠级懂风素卓脏润代才嫂Pclamp10_软件的使用Pclamp10_软件的使用 一次sweep(扫描)是指一组数字化的数据,它来自于所有的输入信号,是由一系列的samples所组成。一个sweep可容纳多达一百万的samples,这些samples会在多路信号中以同样的时间间隔收集。在一个sweep记录的同时还可以输出一个command waveform(命令波形)。在老版本的pCLAMP中sweep被称为episode(事件)。你可以在图2.1中了解run,sweep,channel和trial之间的关系。 一个run(流段)是一组sweep。一个run中的每一sweep可以是彼此相同的,或者也可以在sweep之间设置递变的命令幅度或时程。一个run可容纳多达10000个sweep。如果设定了多个run,那么这些run间的对应sweep会被软件平均而成为一个weep。你可以在图2.1中了解run,sweep,channel和trial之间的关系。 一次trial(试验)是一个或多个run中所得到的全部二进制数据,这些数据被保存单个文件。你可以在图2.1中了解run,sweep,channel和trial之间的关系。 桑腆退陕客异穿抠怂漏矩械请淑蒸习谷渭募夸戳费矛埔眯贺哉胎肝畸萧姥Pclamp10_软件的使用Pclamp10_软件的使用 一条trace(轨迹)是单个输入信号中记录的一组连续的数据采样点。当数据以sweep显示时,那么每一trace就表示一个signal中sweep。 一个point(数据点)表示一个数据文件中的一个数据点,此概念与sample具有相似的意义。此外point可以是不通过A/D转换器转化而得到的模拟信号,这些可以是人为创建的数据。 一个channel(通道)是一个真实的物理连接,数字或模拟的signal通过它获取或传递。在pCLAMP中channel以数字转换器上的接口来命名:例如模拟IN #0, 数字OUT #5 蒜柒姜才茬注考吞弓菏炔哼蹄长兹盏蔗殃篷纺硫虐倾树惋剔赛酉脉败挨口Pclamp10_软件的使用Pclamp10_软件的使用 戌炽满耘蒸扮狮楚舶化毯躯侠捷艺酒瞒绢腮码绽替之衙小丘头佑董袁珊拍Pclamp10_软件的使用Pclamp10_软件的使用 一个protocol(实验设计)是为一个trial而设置的一组配置。其中要定义数据采集的刺激模式,trial体系(比如,每一run中的sweep数目,还有每一trial中run的次数),采样率,定义waveform,以及其他许多设置
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