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国家重大科学研究计划重要支持方向 2013年度 蛋白质研究 1. 重要生物大分子的结构生物学研究 研究具有重要生理和药理功能的生物大分子复合体（含RNA-蛋白复合体）的三维结构；研究具有重要生理和药理功能的膜蛋白（特别是真核膜蛋白）及其与配体和下游调控蛋白复合物的三维结构。支持综合运用多学科方法开展蛋白质的结构研究与功能诠释，揭示其作用的分子机制和生物学功能。 2. 重要生理与病理过程的蛋白质组学研究（C类） 针对重要生理过程或重大疾病的病理过程，应用深度覆盖、动态比较、定量、目标蛋白质组等技术，重点研究其蛋白质组的表达谱和修饰谱，发现和验证若干重要的分子标志物/靶点，揭示蛋白质组（群）及其相关通路的调控规律，以及生理或病理意义。 3. 蛋白质研究的新技术与新方法（C类） 发展蛋白质定性基础上的高精度定量、高分辨结构测定、相互作用和动态过程研究的新技术新方法。特别关注生物大分子复合体、膜蛋白、修饰蛋白质的结构分析和相互作用研究的实验和理论计算新技术新方法；修饰代谢物、金属离子等对蛋白质功能调控机制研究的新技术新策略；高灵敏蛋白质标记及其动态跟踪和影像技术。 4. 蛋白质生成、加工、降解及其调控 研究非编码RNA在蛋白质生成、加工和降解过程中的调控作用；研究膜受体等功能蛋白质在翻译过程中的质量控制机制以及病原体对翻译调控的逃逸和抑制机制。 5. 蛋白质生物学功能研究 针对细胞生命过程中的重大科学问题，研究参与基因转录调控和信号转导过程的关键蛋白质及其复合物的生物学功能，以及与这些关键蛋白质调控相关的非编码RNA生物学功能。 6. 复杂疾病和衰老过程的系统生物学研究 针对复杂疾病和衰老过程的高度复杂性，整合分子、细胞、组织、机体等层次，开展系统生物学研究。系统分析鉴定疾病发生或衰老过程中时序性相关的蛋白质改变及其与基因、代谢分子间的相互作用；阐明其调控网络对疾病发生发展进程的影响及分子机理。综合利用生物信息学和分子网络分析，发现和评价疾病分子标志物和干预靶点。 发育与生殖研究 1. 神经系统发育及分化的调控机制 利用模式动物，重点研究神经发育、微环路建立的分子细胞机制，揭示神经系统发育的调控机理和关键因子，为理解神经系统疾病的发病机理和诊断提供科学依据。 2. 重要组织和器官发育与再生的分子基础 利用多种模式动物，研究并揭示骨骼、淋巴、心血管和肾脏等特定细胞、组织或器官发育、分化、再生和稳态保持的信号通路和关键调控因子，为新药筛选、疾病诊治和干预提供科学依据。 3. 发育相关重大疾病的遗传和分子机理（C类） 利用临床资源及模式动物，通过遗传学、表观遗传学或环境因素分析，揭示发育相关重大疾病，如听觉障碍形成，贫血和新生儿呼吸系统疾病的细胞、组织或器官的分子调控机制，建立相关疾病的早期诊治和干预新技术。 4. 精子发生与男性不育的分子基础 阐释精子发生与成熟过程中的遗传和表观遗传调控机理，探索精子质量维护的新方法，为诊治男性不育症及研发男性避孕药提供基础。 5. 受孕与生殖调控（C类） 重点研究卵子发育的分子机制，环境内分泌干扰物对雌性生殖的影响，受孕的免疫调节，以及相关生殖调控新技术，为女性生殖健康提供理论基础。 6. 植物器官发育与可塑性的分子调节机制 以模式植物和作物为对象，研究植物胚胎与器官发育、生长与衰老的调控网络，阐释植物器官发育可塑性的调节机制，揭示植物生殖关键过程的分子机理。 干细胞研究 1. 成体干细胞的命运决定机制与功能研究 研究成体干细胞（如神经、造血干细胞）发生、发育、分化及维持的分子调控机制；研究干细胞与微环境的相互作用以及信号传导的机理；研究干细胞与功能器官形成和修复的关系及其分子机理。 2. 多能干细胞向中胚层分化机理研究 重点研究多能干细胞诱导分化成中胚层细胞过程中的分子调控网络、表观遗传学、染色体的重塑、结构生物学、诱导因子和微环境等；验证多功能细胞分化为中胚层细胞的生理功能，建立标准化的高效诱导分化和细胞分离纯化体系。 3. 单倍体干细胞获得与倍性维持机制研究 研究单倍体或其他异倍体干细胞建系与分化过程中的染色体倍性维持的机制；揭示细胞周期调控异倍体细胞的编程与重编程的机理；建立基于单倍体干细胞的高通量基因修饰、药物筛选和基因功能鉴定体系。 4. 转分化与重编程过程的表观遗传调控 利用和开发现代分子生物学手段（如高分辨率质谱、高通量序列分析等），研究成体干细胞干性维持、转分化和重编程的表观遗传机理；研究包括但不仅局限于DNA和/或RNA本身及其相互作用蛋白的物理与化学修饰。