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基因的转录和调节
锌指的结构 ③碱性亮氨酸拉链,basic leucine zipper,bZIP,该结构的特点是蛋白质分子的肽链上每隔6个氨基酸就有一个亮氨酸残基,结果导致这些亮氨酸残基都在a螺旋的同一个方向出现。两个相同结构的两排亮氨酸残基就能以疏水键结合成二聚体,该二聚体的另一端的肽段富含碱性氨基酸残基,借其正电荷与DNA双螺旋链上带负电荷的磷酸基团结合。若不形成二聚体则对DNA的亲和结合力明显降低。 基因的转录过程 (三)原核生物的转录终止有两种不同方式 当核心酶沿模板3’一5’方向移行至DNA链的终止部位时,识别模板上特殊结构后便停顿下来不再移动,同时转录产物RNA链从转录复合物上释放出来,即转录终止。原核细胞和真核细胞转录终止机制和方式并不相同,这里主要探讨原核生物的转录终止。原核生物的转录终止分为 两大类,依赖ρ因子, Rho factor的转录终止和不依赖ρ因子的转录终止。 1.依赖ρ因子的转录终止 ρ因子是由6个相同亚基组成的六聚体蛋白,它具有两大生物活性:①解螺旋酶活性;②依赖RNA的ATP酶活性。 一般认为, ρ因子能对含有Poly C的RNA有较强的亲和力,转录终止阶段新合成RNA链出现富集的Poly C序列, ρ因子与其结合后能向RNA聚合酶方向移动,移动需要的能量来自于ATP酶水解ATP提供。p因子接触RNA聚合酶后,二者的构象发生改变,并利用其解螺旋酶活性拆离DNA-RNA杂化双链, 从而使转录产物从转录复合物中完全释放出来,转录终止。 ρ因子参与转录终止过程 2.非依赖ρ因子的转录终止 此种转录终止不需要蛋白因子参与,而是利用新合成的RNA链自身的某些特殊结构来终止转录。在DNA模板链接近转录终止的区域内有较密集的A T配对区和自身互补序列,这样使转录产物RNA的3’端常有若干个连续的U序列和自身互补序列形成的茎环,stemloop结构或发夹结构,hairpin structure。这两种结构是阻止转录继续进行的关键,其原因可能在于,发夹结构形成可能改变了RNA聚合酶构象,导致了酶-模板结合方式的改变,RNA聚合酶则不再向下移动,同时连续的U序列也能促进RNA聚合酶从模板上脱落下来。 RNA的发夹结构与转录终止 真核细胞转录终止方式与原核细胞不同,而是与转录后的修饰密切相关。目前发现,在模板链读码框架的3’端之后,常有一组共同序列AATAAA,再下游还有相当多的GT序列,这些序列称为转录终止的修饰点。当转录越过修饰点后,mRNA在修饰点处被切断,随即加入polyA尾巴和5′帽子结构,并被释放出来。越过修饰点后RNA虽然能继续转录,但很快被降解。 三、初级转录产物需经过转录后加工才具有活性 绝大多数原核生物转录和翻译是同步进行的,在转录生成mRNA的同时,核蛋白体即附着在mRNA上并以其为模板进行蛋白质的合成,因此原核细胞的RNA并无特殊的转录后加工过程。真核生物转录和翻译在时间和空间上是分开的,刚转录出来的RNA是分子很大的前体,需经转录后的加工过程才能转变成成熟的RNA。 (一)hnRNA进行首尾修饰和内含子剪接后转变为成熟的mRNA 真核细胞mRNA前体称为不均一核RNA,hnRNA,它在细胞核内合成,必需经过一系列加工修饰过程才能转变为成熟mRNA,主要加工修饰包括以下几个方面 1.5-末端加上“帽子”结构 在鸟苷酸转移酶催化下,在真核生物hnRNA的5-末端加上一分子鸟苷酸残基。然后对该残基进行甲基化修饰,使其成为7甲基鸟苷酸,该结构称为“帽子”。其功能是 ①增加mRNA稳定性,保护mRNA免遭5′-核酸外切酶的攻击而被降解。②与蛋白质生物合成起始有关。它是mRNA作为翻译起始的必要的结构,可以帮助核蛋白体识别翻译起始部位。原核生物mRNA没有“帽子”结构。 2.在3-末端加上尾结构 大多数真核mRNA都有3’端多聚A尾巴,多聚A尾巴大约为200bp,它不是由DNA编码的,而是转录后在核内加上去的。在多聚腺苷酸聚合酶的催化下,以ATP为底物,在hnRNA的3’末端加上一段多聚腺苷酸,Poly A,该结构称为“尾”。目前认为,polyA尾巴可能与mRNA从细胞核转送到细胞质有关。还有人认为这种结构对真核mRNA的翻译效率具有某种作用,并能稳定mRNA结构,保持一定的生物半衰期。 卵清蛋白基因转录及加工过程 3.hnRNA链的剪接 真核生物基因往往是断裂基因,即编码一个蛋白质分子的核苷酸序列被多个插人片断,内含子,intron所隔开。在转录时,外显子及内含子均转录到hnRNA中,但在细胞核中hnRNA首先在核酸内切酶,endonuclease作用下剪切掉内含子,然后在连接酶,1igase作用下,将外显子,extron
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