分子生物学教案串讲.doc

分子生物学教案串讲 说明：主要是相关的名词解释和课后问题，其它繁杂的知识点请参阅教材与课件。 第一章 名词： peptide bond肽键-The carboxyl group of one amino acid can react with the amino group of another amino acid to form a peptide bond(amide bond-酰胺键). 肽平面(peptide plane)- 由于肽键具有部分双键的性质，使参与肽键构成的六个原子被束缚在同一平面上，这一平面称为 肽平面(peptide plane) 结构域（domain）-是在二级结构或超二级结构的基础上形成三级结构的局部折叠区，相邻的域常被一个或两个多肽片段连结。 亚基（subunit）就是指参与构成蛋白质四级结构、每条具有三级结构的多肽链。 别构调节Allosteric regulation / --酶分子的非催化部位与某些化合物可逆地非共价结合后发生构象的改变，进而改变酶活性状态，称为酶的别构调节。 问题：1.Character of peptide bond； 2. Describing Protein Structure各级结构； 3. 蛋白质的二级(Secondary structure)结构的几种形式； 4. What physical interactions happen in the process of protein folding? （1) Covalent bonding 2)Hydrogen bonding3) Ionic bonding4) Van der Waals forces5) Hydrophobic interaction） 第二章 名词： Base stacking force碱基堆积力: 每个碱基对平行伸展并且与上面的和下面的碱基对非常靠近，这一现象叫做碱基堆积。碱基堆积力是指在DNA双螺旋结构中，碱基对平面垂直于中心轴，层叠于双螺旋的内侧，相邻疏水性碱基在旋进中彼此堆积在一起相互吸引形成的作用力。维持DNA双螺旋结构的稳定的力主要是碱基堆积力. DNA denaturation变性: Under special conditions such as high acid concentration,low salt concentration, or high heat, the two strands of DNA can be separated. Hyperchromycity effect（碱基增色效应，DNA减色效应）：随温度升高，单链状态的DNA不断增加而表现出A260递增的效应。指变性后DNA溶液的紫外吸收作用增强的效应。在DNA双螺旋结构中碱基藏入内侧，变性时DNA双螺旋解开，于是碱基外露，碱基中电子的相互作用更有利于紫外吸收，故而产生增色效应。 melting temperature熔解温度--核酸热变性时，紫外吸收的增加量达到最大增加量一半时的温度值称为熔解温度Tm. renaturation(复性)-变性DNA在适当的条件下，彼此分开的两条单链可以重新缔合成为双螺旋结构，这一过程称为复性。也称之为退火(annealing)。 renaturation zippering effect （复性的拉链效应） :当配对的一部分碱基相互配对时，一般认为约需要20个碱基对。特别是富含G．C的节段先形成氢键，产生一个或几个双螺旋核心(成核作用，nucleation )；然后，两条单链的其余部分就会像“闭合拉链”那样迅速形成双螺旋结构。 Palindrome回文结构序列, 即反复重复序列，是一种旋转对称结构,在轴的两侧序列相同而反向。能在DNA或RNA中形成发夹结构, mirror repeat 镜像重复--由反方向完全相同的两个DNA片断组成的一种对称结构。 hinge DNA-铰链DNA（H-DNA）-双链DNA拆开产生的多聚嘧啶链回折，嵌入剩下的双链DNA major groove 中形成分子内的铰链DNA。 superhelix DNA-在共价闭环双螺旋基础上进一步扭转盘曲,形成麻花状的超螺旋(supercoil)，体积进一步压缩，密度较大。 polycistronic mRNA--原核DNA序列中功能相关的基因丛集在基因组的特定部位，形成转录单元，它们可被一起转录为可翻译多个蛋白质的mRNA分子，这种mRNA叫多顺反子mRNA。 Histone-组蛋白-进化上非常保守的碱性蛋白质，其中碱性氨基酸(Arg，Lys)约占25%，存在于真核生物染色质，分为5种类型(H1，H2A，H2B，H3，H4)，后4种各2个形成组蛋白八聚体，构成核小体的核